双稳
处于双稳的系统有两个平衡状态。在物理学中,对于全体粒子,双稳态源自于它的自由能有三个临界点。其中两个为最小值而最后一个为最大值。通过数学论证,最大值一定处于两个最小值之间。默认情况下,系统的态将处于最小值态两者之一,因为这样对应于系统的最低能量。最大值可以被看作壁垒。
最低自由能态之间的跃迁,需要某些形式的激发能来穿透壁垒(对照化学里的激发能和Arrhenius方程)。当穿越壁垒之后,系统将再一次静止到下一个最低能态。需要的时间称作弛豫时间(哪一个态将成为新态可能会有不确定性,但是通常情况下是被很好地定义了的)。
光学双稳是一些光学器件的属性, 它们往往可能有两个谐振传输态,依赖于输入的情况。
在生物和化学系统中
双稳态是理解细胞内某些现象作用的关键,比如细胞周期过程中的决策、细胞分化[1]和细胞凋亡。它也和某些事件,在早期的细胞内动态平衡的丧失相关,比如癌症的发生、阮病毒疾病甚至新物种形成(成种作用)[2]。
双稳态的产生和具有超敏性的正反馈回路(positive feedback loop)相关。正反馈回路,简单地举例来说,X激活Y,同样Y能激活X,从本质上来说,是将输出信号和输入信号联系在了一起。对于细胞内的信号转导来说,这种调控形式很重要,因为它能够产生“全或无”的开关效应[3]。研究也表明了,非常多的生物系统,比如爪蟾卵的成熟[4]、哺乳动物钙信号的转导和出芽酵母的极性都与(快速或者慢速)正反馈回路相关(在不同的时间点会有多个正反馈回路出现)[3]。如果一个系统同时拥有这两类正反馈回路,这样可以(a)增加调节:两种开关有着独立的可变的激活或者失活时间;(b)将反馈回路和多重时间尺度联系起来可以过滤噪声[3]。
双稳态可以被修饰地更加具有稳健性,即使体系中反应物的浓度发生很大的改变,其仍能维持着“开关”这种特性。一个细胞生物学上的例子,被激活的CDK1(Cyclin Dependent Kinase 1,细胞周期蛋白依赖的激酶1)能够激活它的激活子Cdc25,同时CDK1也会灭活它的抑制子Wee1,这样能够使细胞进入有丝分裂(mitosis)。如果没有这种双重反馈,尽管系统仍能够具有双稳性,但是不能够承受体系中反应物浓度的有较大的波动[5]。
双稳态在果蝇胚胎发育阶段中被描述过,比如头尾轴[6]和腹背轴的形成[7][8],以及眼睛的发育[9]。
在生物系统中,和双稳态有关的一个典型的例子是Sonic hedgehog (Shh),一种分泌的信号分子,对发育非常重要。Shh信号网络表现为一个双稳态的开关一样,其浓度能够引起细胞状态的转变。Shh可以激活gli1 和 gli2的转录,它们各自的基因产物也能够作为转录激活物去促进自身和Shh信号通路下游基因的表达[10]。同时,Shh信号通路也包含一个负反馈回路,即Gli转录因子能够激活阻遏子Ptc的转录活性。因此,Shh信号通路中同时存在的正负反馈回路能够产生双稳态开关[2]。
在生物和化学系统中,只要满足三个条件,就能够产生双稳态现象:正反馈、过滤小刺激信号的机制和防止无约束增长的机制。双稳态化学系统被广泛地用于研究非平衡热动力学、随机共振和气候变化等等[2]。在双稳态空间扩展系统中,局部相关性的发生和旅行波的传播曾被分析过[11][12]。
双稳态通常可以通过滞后作用(hysteresis)来实现。从种群水平,如果将每一个个体加以考虑,在分布上就会出现双稳态现象。
参见
外部連結
- ^ Ghaffarizadeh, Ahmadreza; Flann, Nicholas S.; Podgorski, Gregory J. Multistable switches and their role in cellular differentiation networks. BMC bioinformatics. 2014,. 15 Suppl 7: S7 [2019-01-10]. ISSN 1471-2105. PMC 4110729 . PMID 25078021. doi:10.1186/1471-2105-15-S7-S7. (原始内容存档于2019-01-10).
- ^ 2.0 2.1 2.2 Wilhelm, Thomas. The smallest chemical reaction system with bistability. BMC systems biology. 2009-09-08, 3: 90 [2019-01-10]. ISSN 1752-0509. PMC 2749052 . PMID 19737387. doi:10.1186/1752-0509-3-90. (原始内容存档于2019-01-10).
- ^ 3.0 3.1 3.2 Brandman, Onn; Ferrell, James E.; Li, Rong; Meyer, Tobias. Interlinked fast and slow positive feedback loops drive reliable cell decisions. Science (New York, N.Y.). 2005-10-21, 310 (5747): 496–498 [2019-01-10]. ISSN 1095-9203. PMC 3175767 . PMID 16239477. doi:10.1126/science.1113834. (原始内容存档于2019-01-10).
- ^ Ferrell, J. E.; Machleder, E. M. The biochemical basis of an all-or-none cell fate switch in Xenopus oocytes. Science (New York, N.Y.). 1998-05-08, 280 (5365): 895–898 [2019-01-10]. ISSN 0036-8075. PMID 9572732. (原始内容存档于2019-01-10).
- ^ Ferrell, James E. Feedback regulation of opposing enzymes generates robust, all-or-none bistable responses. Current biology: CB. 2008-03-25, 18 (6): R244–245 [2019-01-10]. ISSN 0960-9822. PMC 2832910 . PMID 18364225. doi:10.1016/j.cub.2008.02.035. (原始内容存档于2019-01-10).
- ^ Spirov, Alexander V.; Bisch, Paulo M.; Holloway, David M.; Vieira, Fernando M. C.; Lopes, Francisco J. P. Spatial Bistability Generates hunchback Expression Sharpness in the Drosophila Embryo. PLOS Computational Biology. 2008-09-26, 4 (9): e1000184 [2020-10-03]. ISSN 1553-7358. PMC 2527687 . PMID 18818726. doi:10.1371/journal.pcbi.1000184. (原始内容存档于2020-07-26) (英语).
- ^ Ferguson, Edwin L.; Wang, Yu-Chiun. Spatial bistability of Dpp–receptor interactions during Drosophila dorsal–ventral patterning. Nature. 2005-03, 434 (7030): 229–234 [2019-01-10]. ISSN 1476-4687. doi:10.1038/nature03318. (原始内容存档于2022-01-21) (英语).
- ^ Umulis, David M.; Serpe, Mihaela; O'Connor, Michael B.; Othmer, Hans G. Robust, bistable patterning of the dorsal surface of the Drosophila embryo. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2006-08-01, 103 (31): 11613–11618 [2019-01-10]. ISSN 0027-8424. PMC 1544218 . PMID 16864795. doi:10.1073/pnas.0510398103. (原始内容存档于2019-01-10).
- ^ Graham, Thomas G. W.; Tabei, S. M. Ali; Dinner, Aaron R.; Rebay, Ilaria. Modeling bistable cell-fate choices in the Drosophila eye: qualitative and quantitative perspectives. Development (Cambridge, England). 2010-7, 137 (14): 2265–2278 [2019-01-10]. ISSN 1477-9129. PMC 2889600 . PMID 20570936. doi:10.1242/dev.044826. (原始内容存档于2019-01-10).
- ^ Lai, Karen; Robertson, Matthew J.; Schaffer, David V. The sonic hedgehog signaling system as a bistable genetic switch. Biophysical Journal. 2004-5, 86 (5): 2748–2757 [2019-01-10]. ISSN 0006-3495. PMC 1304145 . PMID 15111393. doi:10.1016/S0006-3495(04)74328-3. (原始内容存档于2019-01-10).
- ^ Elf, J.; Ehrenberg, M. Spontaneous separation of bi-stable biochemical systems into spatial domains of opposite phases. Systems Biology. 2004-12, 1 (2): 230–236 [2019-01-10]. ISSN 1741-2471. PMID 17051695. (原始内容存档于2019-01-10).
- ^ Kochanczyk, Marek; Jaruszewicz, Joanna; Lipniacki, Tomasz. Stochastic transitions in a bistable reaction system on the membrane. Journal of the Royal Society, Interface. 2013-07-06, 10 (84): 20130151 [2019-01-10]. ISSN 1742-5662. PMC 3673150 . PMID 23635492. doi:10.1098/rsif.2013.0151. (原始内容存档于2019-01-10).