嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Mu變異株
嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型-Mu變異株(英語:SARS-CoV-2 Mu variant),別名B.1.621譜系 (英語:Lineage B.1.621),是嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒2型(SARS-CoV-2)的一種變異株。於2021年七月在哥倫比亞被發現並在同年8月30日被WHO標示為「需留意變異株」(VOI)。[1]WHO稱這個變種擁有可能使疫苗失效的突變,並表示必須深入研究以徹底了解此種變異株。[2]Mu變異株已被通報在南美洲與歐洲擴散。[3]
B.1.621譜系擁有一個子譜系,依PANGO命名規則編號為B.1.621.1, 目前已被發現散布到全世界20餘國。[4]
命名
2021年一月,此變異株首度在哥倫比亞被發現,並被命名為 B.1.621。[5]
變異
Mu變異株的基因體擁有21個突變位,包括9個胺基酸突變,棘蛋白編號分別為: T95I、Y144S、Y145N、R346K、E484K,以及逃脫變異N501Y、D614G、P681H、以及D950N。[7]病毒突變並不罕見。每一種病毒,包括SARS-CoV-2,每隔一段時間就會變化。 大部分的突變是無關緊要的,但一些突變可以增強病毒的威力或對藥物、疫苗產生免疫逃避。[3] 一項在羅馬一間實驗室進行的研究[8]測試了輝瑞-BioNTech疫苗對Mu變異株的療效,並發現: 雖然Mu變異株在棘蛋白上有許多突變,輝瑞疫苗仍能有效將其消滅。而相較於其他變種株,輝瑞疫苗雖然有效,但其誘發的抗體消滅Mu變異株的效果大大減弱。[5]
-
SARS-CoV-2 Mu變異株基因體棘蛋白部分的胺基酸變異圖[9]
基因編號 | 突變之胺基酸編號 |
---|---|
ORF1a | T1055A |
T1538I | |
T3255I | |
Q3729R | |
ORF1b | P314L |
P1342S | |
棘蛋白(S) | T95I |
Y144S | |
Y145N | |
R346K | |
E484K | |
N501Y | |
D614G | |
P681H | |
D950N | |
ORF3a | Q57H |
del257/257 | |
ORF8 | T11K |
P38S | |
S67F | |
核殼蛋白(N) | T205I |
歷史
2021年8月
8月30日,日本宣布確診境內首兩例Mu變異株患者,分別是一名40歲左右的女性,於8月26日自阿拉伯聯合大公國入境。另一名為50多歲女性,於7月5日由英國入境。此兩例皆為無症狀感染者。[10]
2021年9月
9月2日:
- 中華民國中央流行疫情指揮中心宣布發現臺灣第一例Mu變種株確診個案,為一位60多歲本國籍女性,自美國入境,且已接種2劑輝瑞疫苗。她在7月5日於美國接種第一劑輝瑞疫苗,並於7月26日接種第二劑。當她於8月3日返國時,起先並未回報有任何症狀,後於機場檢疫時確診COVID-19。[11][12]
- 瓜地馬拉通報境內首兩例女性Mu變異株患者,分別為19及25歲。兩名患者皆無旅遊史與疫苗接種史。病人隨即被安置在位於瓜地馬拉市的醫院。[13]
9月3日:
- 希臘通報境內首六例Mu變異株確診案例。其中四例為境外移入。[14]
- 香港通報境內首三例Mu變異株確診案例。其中兩例為19歲男性與22歲女性,曾入境瓜地馬拉,確認在六月初時就已感染Mu變異株,另一26歲女性,自美國入境,於7月24日確診。香港同時也新增了四例境外移入COVID-19病例,皆為由菲律賓入境之移工。[15]
- 南韓通報境內首三例Mu變異株確診案例。疾病管理廳宣布確診3例由墨西哥、美國及哥倫比亞入境之境外移入病例。[16]
9月4日:
統計數據
國家 | 病例數 | |||
---|---|---|---|---|
來自GISAID[18] | 來自outbreak.info[7] | 來自其他來源 | ||
美国 | 2,400 | 2,216 | ||
哥伦比亚 | 965 | 877 | ||
西班牙 | 512 | 512 | ||
墨西哥 | 367 | 357 | ||
厄瓜多尔 | 170 | 170 | ||
阿鲁巴 | 84 | 84 | ||
義大利 | 82 | 77 | ||
智利 | 84 | 73 | ||
荷蘭 | 75 | 72 | 44[19] | |
英国 | 61 | 55 | 53[20] | |
波多黎各 | – | 51 | ||
奥地利 | 49 | 49 | ||
哥斯达黎加 | 49 | 49 | ||
瑞士 | 48 | 48 | ||
加拿大 | 114 | 69 | ||
多米尼加 | 46 | 46 | ||
比利时 | 36 | 36 | ||
葡萄牙 | 24 | 24 | ||
英屬維爾京群島 | 21 | 21 | ||
库拉索 | 20 | 20 | ||
德国 | 14 | 14 | ||
秘魯 | 14 | 14 | ||
法國 | 21 | 16 | ||
巴西 | 11 | 11 | ||
荷蘭加勒比區 | 8 | 8 | ||
丹麦 | 7 | 7 | ||
波蘭 | 6 | 6 | ||
委內瑞拉 | 5 | 5 | ||
愛爾蘭 | 4 | 4 | 4[17] | |
芬兰 | 3 | 3 | ||
荷屬聖馬丁 | 3 | 3 | ||
斯洛伐克 | 3 | 3 | ||
瑞典 | 4 | 4 | ||
开曼群岛 | 2 | 2 | ||
香港 | 2 | 2 | 3[15] | |
日本 | 2 | 2 | 2[10] | |
土耳其 | 2 | 2 | ||
巴巴多斯 | 1 | 1 | ||
直布罗陀 | 1 | 1 | ||
以色列 | 1 | 1 | ||
列支敦斯登 | 1 | 1 | ||
盧森堡 | 2 | 2 | ||
馬爾他 | 1 | 1 | ||
羅馬尼亞 | 1 | 1 | ||
韩国 | 1 | 1 | 3[16] | |
特克斯和凯科斯群岛 | 1 | 1 | ||
希腊 | – | – | 6[14] | |
危地马拉 | – | – | 2[13] | |
臺灣 | – | – | 1[11] | |
共計: | 5,328 | 5,022 | 118 |
參見
参考文献
- ^ 1.0 1.1 Tracking SARS-CoV-2 variants. who.int. World Health Organization. [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-06-18) (英语).
- ^ WHO monitoring new coronavirus variant named 'Mu'. france24.com. September 1, 2021 [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-09-01) (英语).
- ^ 3.0 3.1 Why Has WHO Designated 'Mu' A Variant Of Concern? Find Out All About It. ndtv.com. September 1, 2021 [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-09-01) (英语).
- ^ Lineage B.1.621.1. cov-lineages.org. [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-08-31) (英语).
- ^ 5.0 5.1 Mu COVID variant: All you need to know about the new UK coronavirus strain. BBC Science Focus Magazine. [2021-09-01]. (原始内容存档于2021-09-01) (英语).
- ^ Variants: distribution of cases data. gov.uk. Government Digital Service. [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-06-07).
- ^ 7.0 7.1 7.2 Mu Lineage Report. outbreak.info. [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-09-01).
- ^ Messali, S., Bertelli, A., Campisi, G., Zani, A., Ciccozzi, M., Caruso, A. and Caccuri, F.(2021). A cluster of the new SARS-CoV-2 B.1.621 lineage in Italy and sensitivity of the viral isolate to the BNT162b2 vaccine.. Journal of Medical Virology. [2020-09-04].
- ^ SARS-CoV-2 variants - Stanford Coronavirus Antiviral & Resistance Database. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database. [September 1, 2021]. (原始内容存档于2021-06-30).
- ^ 10.0 10.1 Japan confirms first cases of mu variant of COVID-19. thebharatexpressnews.com. September 2, 2021 [September 2, 2021]. (原始内容存档于September 2, 2021).
- ^ 11.0 11.1 Taiwan reports its 1st imported case of Mu COVID variant. Taiwan News. September 3, 2021 [September 3, 2021]. (原始内容存档于2021-11-27).
- ^ 疾管署. 新增19例COVID-19確定病例,分別為16例本土及3例境外移入. 2021-08-03 [2021-09-04].
- ^ 13.0 13.1 The “MU” variant is already in Guatemala. Is it immune to vaccines?. bullfrag.com. [September 4, 2021]. (原始内容存档于2021-11-27) (英语).
- ^ 14.0 14.1 Κορονοϊός - Μετάλλαξη Mu: Έξι κρούσματα στην Ελλάδα - Πού εντοπίστηκαν. ethnos.gr. [September 3, 2021]. (原始内容存档于2021-09-03) (希腊语).
- ^ 15.0 15.1 Coronavirus: three cases of new Mu variant found in Hong Kong arrivals, authorities reveal. South China Morning Post. [September 3, 2021]. (原始内容存档于2021-11-27) (英语).
- ^ 16.0 16.1 3 Mu variant cases detected in South Korea. malaysianow.com. September 3, 2021 [September 4, 2021]. (原始内容存档于2021-09-04) (英语).
- ^ 17.0 17.1 Neville, Steve. Four Covid cases associated with Mu variant identified in Ireland. Irish Examiner. 4 September 2021 [5 September 2021]. (原始内容存档于2021-11-27).
- ^ Tracking of Variants. gisaid.org. [September 5, 2021]. (原始内容存档于2021-06-23).
- ^ Variants of the coronavirus SARS-CoV-2. rivm.nl. [September 4, 2021]. (原始内容存档于2021-07-09).
- ^ Variants: distribution of case data, 3 September 2021. gov.uk. Government Digital Service. [September 4, 2021]. (原始内容存档于2021-09-03).