平井毓太郎(日語:ひらい いくたろう,1865年11月28日[1]—1945年[2]1月12日)是日本醫生,曾任京都帝國大學教授,舊姓木場,三重縣出身。
平井毓太郎曾於1914年提名野口英世角逐諾貝爾獎。