File:Plastomap of Arabidopsis thaliana.svg

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摘要

描述
English: The plastid genome of a model flowering plant (Arabidopsis thaliana: Brassicaceae).

Chloroplast genome map of Arabidopsis thaliana (154,478 bp ; NCBI accession number NC_000932.1Sato S., Nakamura Y., Kaneko T., Asamizu E. and Tabata S., 1999. Complete structure of the chloroplast genome of Arabidopsis thaliana. DNA Research 6 (5), 283-290.). The 136 genes are color coded: small subunit ribosomal proteins (rps, yellow), large subunit ribosomal proteins (rpl, orange), hypothetical chloroplast open reading frames (ycf, lemon), protein-coding genes either involved in photosynthetic reactions (green) or in other functions (red), ribosomal RNAs (rrn, blue), and transfer RNAs (trn, black). Introns are in grey. Some genes consist of 5′ and 3′ portions. Strand 1 and 2 genes are transcribed clockwise and counterclockwise, respectively.

The innermost circle provides the boundaries of the large and small single copy regions (LSC and SSC, violet) separated by a pair of inverted repeats (IRa and IRb, black).
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