DGCR8

位於22號人類染色體的基因

DGCR8全稱為迪喬治症候群關鍵區域8(DiGeorge syndrome critical region 8)是哺乳類的一個蛋白質,在人類基因組中由22號染色體上的DGCR8基因編碼[4]模式生物黑腹果蠅秀麗隱桿線蟲與此同源的基因名為Pasha,意為「Drosha蛋白的夥伴」(partner of Drosha)[5]

DGCR8
已知的結構
PDB直系同源搜索: PDBe RCSB
識別號
别名DGCR8;, C22orf12, DGCRK6, Gy1, pasha, Pasha, DGCR8 microprocessor complex subunit, microprocessor complex subunit
外部IDOMIM609030 MGI2151114 HomoloGene11223 GeneCardsDGCR8
基因位置(人类
22號染色體
染色体22號染色體[1]
22號染色體
DGCR8的基因位置
DGCR8的基因位置
基因座22q11.21起始20,080,232 bp[1]
终止20,111,877 bp[1]
RNA表达模式




查阅更多表达数据
直系同源
物種人類小鼠
Entrez
Ensembl
UniProt
mRNA​序列

​NM_001190326
​NM_022720

NM_033324

蛋白序列

NP_001177255
​NP_073557

NP_201581

基因位置​(UCSC)Chr 22: 20.08 – 20.11 Mb无数据
PubMed​查找[2][3]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

功能

DGCR8位於細胞核中,參與miRNA前驅物(pri-miRNA)的切割,此蛋白可與Drosha(一種核糖核酸酶Ⅲ)結合,組成微加工複合體英语Microprocessor complex,將由DNA轉錄產生的pri-miRNA切割成長約70nt的pre-miRNA,後者可再由Dicer切割產生成熟的miRNA。DGCR8有一可與RNA結合的結構域,可與pri-miRNA結合以穩定其結構,以利Drosha進行切割[6]。Drosha一般需在與DGCR8結合的情況下才能進行切割[7]

此外DGCR8也參與部分DNA修補的途徑,DGCR8的一個位點被磷酸化後可參與转录偶联修复(transcription coupled nucleotide excision repair,簡稱TC-NER,用於移除嘧啶二聚體紫外線造成的DNA損傷)以及核苷酸切除修復(NER,移除過氧化氫等化學物質造成的DNA氧化損傷)等,且此機制與DGCR8和Drosha結合以及和RNA結合的能力均無關[8]

參考文獻

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000128191 - Ensembl, May 2017
  2. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  3. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ Entrez Gene: DGCR8 DiGeorge syndrome critical region gene 8. (原始内容存档于2010-12-05). 
  5. ^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ. Processing of primary microRNAs by the Microprocessor complex. Nature. Nov 2004, 432 (7014): 231–5. PMID 15531879. doi:10.1038/nature03049. 
  6. ^ Yeom KH, Lee Y, Han J, Suh MR, Kim VN. Characterization of DGCR8/Pasha, the essential cofactor for Drosha in primary miRNA processing. Nucleic Acids Research. 2006, 34 (16): 4622–9. PMC 1636349 . PMID 16963499. doi:10.1093/nar/gkl458. 
  7. ^ Han J, Lee Y, Yeom KH, Nam JW, Heo I, Rhee JK, Sohn SY, Cho Y, Zhang BT, Kim VN. Molecular basis for the recognition of primary microRNAs by the Drosha-DGCR8 complex. Cell. 2006, 125 (5): 887–901. PMID 16751099. S2CID 453021. doi:10.1016/j.cell.2006.03.043 . 
  8. ^ Calses PC, Dhillon KK, Tucker N, Chi Y, Huang JW, Kawasumi M, Nghiem P, Wang Y, Clurman BE, Jacquemont C, Gafken PR, Sugasawa K, Saijo M, Taniguchi T. DGCR8 Mediates Repair of UV-Induced DNA Damage Independently of RNA Processing. Cell Rep. 2017, 19 (1): 162–174. PMC 5423785 . PMID 28380355. doi:10.1016/j.celrep.2017.03.021.