等位基因频率

等位基因频率群体遗传学的术语,用来显示一个种群中特定基因座上各个等位基因所占的频率,或者说是等位基因在基因库中的丰富程度。

定义

等位基因频率的定义如下:

如果
  1. 一个染色体中存在某特定基因座
  2. 一个种群有N个个体,每一个个体的染色体套数为n(例如二倍体生物的体细胞中有两个该特定基因座),
  3. 等位基因在种群中有i份;

那么等位基因频率为i/(Nn)。

举例来说,如果在某种群中一个等位基因的基因频率为20%,那么在种群的所有成员中,1/5的染色体带有那个等位基因,而其他4/5的染色体带有该等位基因的其他对应变种——可以是一种也可以是很多种。

值得注意的是在二倍体基因中,带有该等位基因的个体最多可能有2/5。如果等位基因随机分布的话,那么可以用二项式定理来计算:种群中32%的个体会是该等位基因的杂合体(带有一个该等位基因和另一个变种), 4%的个体为该等位基因的纯合体(带有两个该等位基因)。所以加起来就有36%的个体带有该等位基因。然而,等位基因的随机分布是在选择不参与和其他前提下成立的。当这些前提成立时,一个种群的状态被称为哈蒂-温伯格平衡

一个基因中所有等位基因的频率可以被绘制为等位基因分布柱状图群体遗传学研究的内容包括影响等位基因频率的因素-换句话说,演化。除了自然和人工选择外,这些因素还包括遗传漂变突变迁移

例子

如果在一个种群中有10个个体,一个特定基因座有两个可能的等位基因A和a,个体的基因型分别为:

AA, Aa, AA, aa, Aa, AA, AA, Aa, Aa, 和 AA

那么等位基因A和a的等位基因频率分别为:

pA = (2+1+2+0+1+2+2+1+1+2)/20 = 0.7
pa = (0+1+0+2+1+0+0+1+1+0)/20 = 0.3

当然,也可以分开单独计算AA、Aa、aa个体的频率再加起来除。因为此基因座仅有A和a二种等位基因,因此 pA + pa = 1(100%),所以 pa 也可以这样计算:

pa = 1-0.7 = 0.3

参考文献

外部链接

参见