美国南达科他州共有66个县。1862年4月,达科他领地南部共成立14个县,其中11个县至今仍然存在。此后20多年间县份数量迅速上升,州内于1890年时便有多达77个县。其后部分县与邻近的县合并,使州内的县份数量逐渐下降。州内最新建立的县为琼斯县,其于1916年11月7日成立,县政府于1917年1月15日组成。随着1945年华盛顿县并入香农县(今奥格拉拉-拉科塔县)、1952年阿姆斯特朗县并入杜威县、1983年沃沙博县并入杰克逊县,州内的县份数量便维持在66个。