人吉藩（日语：人吉藩／ひとよしはん Hitoyoshi han */?）是日本肥后国部球磨地方的一个藩。藩厅是人吉城。
1193年相良氏创立，经历过室町时代及战国时代成为了战国大名，然后成为江户时代的藩主，直到废藩置县为止。
1587年，丰臣秀吉大军入侵九州，家臣深水长智向秀吉诉苦，成为了秀吉的家臣，因而保留了领地。1600年关原之战期间，支持石田三成，战后受秋月种长、高桥元种的影响下而向德川家康叛变，结果保住了领地。
1871年废藩置县后为人吉县。然后成为八代县、白川县后，成为了熊本县的一部份。1884年以子爵身份封为华族。
外样 22,000石
