方殿元,字蒙章,号九谷[1],广东承宣布政使司广州府番禺县(今广东省广州市)人,清朝政治人物、进士出身。
顺治十一年,乡试中举。康熙三年(1664年),登进士,担任剡城县、江宁县等县知县[2][3]。
有子方还、方朝。