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生命史

生命演化的歷史

关于生命演化更简明的概要，请见“生命演化历程”。

生命史追溯从生命最初出现在地球至今，由现存生物和各种化石所呈现的生命演化过程。地球大约形成于45亿年前，有证据表明已知最古老的生命诞生于约37亿年前[1][2][3]。虽然也有一些化石表明早在41至42.8亿年前就可能有生命存在，但这些所谓的化石可能形成于非生物原因，因此仍有争议[1][4][5][6]。

现今所有已知物种间的相似性表明，它们是从某个共同起源演化而来的[7]。目前地球上约有1兆个物种[8]，其中已命名的只有约175－180万个[9][10]，数据库中得到记录的约有180万种[11]。目前尚存的物种数目占地球上曾存在过所有物种的不到1%[12][13]。

简史

地球形成于约45.4亿年前，在冥古宙早期曾遭受另一矮行星的撞击，起初地表遍布炽热的岩浆。在之后一亿年的时间内地球表面仍然是地质活动剧烈、火山喷发遍布、熔岩四处流动，但因当时大气层的气压较高使得一部分水仍保持液态而形成了少量原始海洋。在41亿年前到38亿年前期间，地表逐渐冷却固化形成了相对稳定的地壳刚块，大气中的水蒸气也大多因气温降低而凝结降下，但地球仍然持续遭到了大量小行星与彗星的撞击，据估计每100年就会造成严重的地表环境破坏，直到始太古代中期天体撞击结束后才形成了适合生命起源的稳定环境条件。太古宙的地球与现今十分不同，是个地表绝大部分面积被浩瀚的超级海洋覆盖的海洋行星，只有少量陆地露出海面，大气层中除氮气外二氧化碳、甲烷和硫化氢的成分很高，也几乎没有游离氧气。

已知最古老的生命证据来自格陵兰西部37亿年前的变质沉积岩中的生物碳特征[2][3]及叠层岩化石[14]。2015年，西澳大利亚州又在41亿年前的岩层中发现了可能的“生物质遗迹”[15][5]。2017年3月，加拿大魁北克努夫亚吉图克绿岩带的海底热泉沉淀物中发现了微生物化石，这可能是地球上最古老的生命形式的推定证据，最早可能生活在42.8亿年前，说明在44亿年前海洋形成后很短时间就出现了原始生命[16][17]。学术界一般认为，细胞生物的最后共同祖先（LUCA）应该出现在35至38亿年前的古太古代。由细菌和古菌共存组成的原核微生物菌毯是主要生命形式，早期演化的重要步骤大都发生于此[18]。

早期的微生物生态系统主要局限在深海附近依赖热泉喷出的各种无机物和地热能进行化合作用，后来一些菌群演化成了可以利用日光的光养生物，从而可以向远离深海的区域扩散。最初成功延伸到浅海和潮间带的主要是以视黄醇为基础吸收绿光驱动的膜蛋白质（紫膜质）直接生产三磷酸腺苷进行不产氧光合作用的古菌群落，甚至有证据表明这些原始菌落至少在27～29亿年前就延伸到陆地上[19]，以至于使得当时的地表呈现紫色[20]。之后能用卟啉衍生物菌绿素为反应中心吸收红光和蓝光来分解硫化氢获取氢正离子与二氧化碳结合进行不产氧光合作用（过程中会产生硫化物）的细菌在大约在35亿年前出现，随后以另一类卟啉衍生物叶绿素为基础的来分解水分子生产碳水化合物的产氧光合作用也由蓝绿菌演化出来，其固碳的副产品——氧气——在大气层中逐渐聚集，在之后十亿年间终于耗尽了海洋、地表和大气层中的亚铁、硫、甲烷等还原剂并于24亿年前引发了大氧化事件[21]，永久性的改变了大气层的化学成分并引发了历时三亿年的全球性大冰期——休伦冰河时期。因为游离的氧气对有机物具有极大氧化毒性，加上气候变化的双重打击，当时以厌氧菌为主的生物圈遭到重创，很可能引发了地球上最早也是广义上最大规模的一次灭绝事件。直到可以进行有氧呼吸的好氧菌出现，厌氧菌与好氧菌相伴共生的生物圈才得以恢复。

很可能是厌氧古菌和好氧细菌发生内共生而演化出的真核生物（有内膜系统并携带细胞器的复杂细胞）大约诞生于18.5亿年前或更早的古元古代[22][23][23]，因为由内共生好氧菌演化出的线粒体可以利用氧气进行有氧代谢产生大量的化学能，使得真核细胞可以成长到原核生物大小的数万倍，并开始以胞吞的形式掠食其它细胞。约17亿年前，多细胞生物开始出现，并前后发生过至少25次独立的多细胞演化，但从18亿年前到8亿年前的整整十亿年间生物的整体演化速度较慢，直到进入新元古代的拉伸纪后多样化的进程逐渐加速。细胞分化创造出有着专门功能的不同细胞[24]，其中包括原始的肌肉细胞，有统一形变能力的早期动物（比如丝盘虫和原始海绵）也开始出现。

原始质体生物最早在16亿年前就出现在淡水中，很可能是由某种真核细胞与蓝绿菌发生内共生而演化而成，这使得真核生物首次具有了光合作用的能力，并与演化出固氮能力的蓝绿菌一起在新元古代引发了第二次大氧化事件。而绿色质体生物（绿藻，以及后来由此演化的植物）最早出现在10亿年前[25]，在经历了成冰纪几轮冰期后，绿藻在约7.5亿年前取代了蓝绿菌成为海洋初级生产的主力，并战胜红藻和褐藻成为淡水系统的主流光合生物。熬过雪球地球的多细胞生物也在5.75亿年前的艾迪卡拉纪迎来了一轮主要由海绵和一群形似海鳃的奇异底栖生物主导的鼎盛时期，史称阿瓦隆大爆发[26]，扁盘动物、刺胞动物和两侧对称动物也大约在这个时期出现于5.55亿年前[27]。与之前完全依赖无性生殖的简单生物不同，由雌雄生殖细胞（配子）在受精中结合为受精卵来实现繁殖的有性生殖被演化出来[28]，其过程对生物学家来说则仍是一个谜，尽管它确实是从单细胞真核生物的共同祖先那里演化来的[29]。然而在埃迪卡拉纪末期灭绝事件中几乎所有的埃迪卡拉生物群都集体消亡，随后被有坚硬口器和骨骼系统的生物取代。元古宙也随之结束，地球进入有明显化石记录的显生宙。

显生宙古生代新崛起的生物包括有明显活动能力的真后生动物——特别是由两侧对称动物分化出的前口动物和后口动物，在进入寒武纪后很可能陷入了演化军备竞赛，因此在约5.25亿年前出现了一个大规模的演化辐射，大多数现代生物门都源自这个史称寒武纪大爆发的演化事件[30]。寒武纪生物圈主要以海洋无脊椎动物为主，特别是三叶虫、奇虾、腕足动物、软舌螺、古杯动物、水母、珊瑚、栉板动物和早期棘皮动物，以及以皮卡虫为代表的原始脊索动物，以昆明鱼和海口鱼为代表的早期脊椎动物也在5.2亿年前至4.9亿年前间出现。随着寒武纪末灭绝事件，以板足鲎（海蝎）等螯肢动物为代表的泛节肢动物和以房角石为代表的早期头足动物在4.75亿年前的奥陶纪迎来了繁盛时期。同时期也开始逐渐繁盛的是以牙形石和甲胄鱼为代表的无颌类脊椎动物，直至奥陶纪晚期有颌鱼类开始出现。一些节肢动物也离开水面成为最早的陆生动物，包括最早的昆虫纲、蛛形纲和多足纲。同样出现在陆地上的是高等真菌和一批紧跟着球囊霉一起向干燥环境扩展的绿藻近亲——以苔藓为主的有胚植物，随后有木质素可以克服重力长高的维管植物在4.23亿年前的志留纪也开始出现。早期植物的成功登陆和多样化从志留纪延续到了泥盆纪，甚至可能因为根部的进化扩展侵蚀岩层表面并释放了大量的矿物质进入水体导致藻华[31]。泥盆纪同时也是有颌鱼类开始繁盛的时期，在志留纪晚期就出现的盾皮鱼、棘鱼和硬骨鱼都先后多样化并开始用积极的游动掠食抢占被奥陶纪末大灭绝重创的板足鲎和房角石空出的生态位，而硬骨鱼的一支——肉鳍鱼则开始演化出开始以提塔利克鱼为代表的四足形类。随后的泥盆纪后期灭绝事件彻底终结了螯肢动物、盾皮鱼和甲胄鱼等生物的繁盛，但硬骨鱼和由棘鱼演化出的软骨鱼得到了空间开始兴盛。

进入石炭纪后，以石松为主的蕨类植物开始向内陆扩展，并且出现了日后形成煤层的繁盛煤炭森林，在大大提高了大气氧量的同时也彻底改变了陆地环境，使得可以持水并掺杂有机质的土壤开始永久性覆盖裸露的岩石。这种植被环境滋养了大量陆生动物，其中包括巨型节肢动物（比如有史以来最大的陆生无脊椎动物节胸蜈蚣）和有翅昆虫（比如著名的巨脉蜻蜓），真正意义上的四足动物——两栖动物也在这一时期出现在陆地上，其中离片椎类更是成为了淡水湿地和河岸林地的顶级霸主。在约3.12亿年前石炭纪后页的宾夕法尼亚世中期，能远离水体繁殖的羊膜动物从两栖动物中演化出来，并很快分出蜥形纲和合弓纲两大演化支。随着3.05亿年前石炭纪雨林崩溃事件造成了煤炭森林的生境破碎化，更适合干冷气候的裸子植物开始取代依赖湿地环境的蕨类成为主流的陆生植物，同时巨型节肢动物的衰落使得羊膜动物可以迅速向内陆扩展生态位。

进入二叠纪后，当时的气候仍受晚古生代大冰期影响，小规模的冰期和间冰期循环不断，直到乌拉尔世晚期才开始回暖。但当时世界上的陆地板块已经连接成一个超大陆——盘古大陆，内陆腹地因为无法得到海风带去水气而开始形成广大面积的沙漠，更适应这种气候变化的种子蕨和松柏等木本植物开始繁盛。二叠纪的陆地主要是合弓纲主宰的天下[32]，早期由盘龙目称霸，但在约2.73亿年前瓜达洛普世初的一次灭绝事件中衰败，其后代的一支——兽孔目的恐头兽接管了陆地统治地位，但恐头兽也在约2.65亿年前瓜达洛普世末期因峨嵋山暗色岩喷发引起的灭绝事件中灭绝。二叠纪晚期乐平世的陆地主要由二齿兽、丽齿兽、麝喙兽和犬齿兽等兽孔目动物占据，但随后在约2.52亿年前西伯利亚暗色岩超级火山喷发引起的二叠纪—三叠纪灭绝事件中，70％的陆生脊椎动物以及高达96％的海洋生物全都灭亡[33]，地球也告别了古生代进入中生代。

在三叠纪早期劫后余生的恢复过程中，离片椎类、初龙形类和三支幸存的兽孔目合弓纲（二齿兽、兽头兽和犬齿兽）等先锋物种曾短期兴盛，其中二齿兽下目的水龙兽数量更是曾达到陆地动物总数的75％之多（在一些地区甚至达到当地的95％）。但随着奥伦尼克期因为西伯利亚暗色岩在2.49亿年前再次喷发而引起的灭绝事件重创了离片椎类和合弓纲，主龙类（主要分伪鳄和鸟颈类主龙两支）因其基于尿酸的泌尿系统比合弓纲基于尿素的泌尿系统更能适应愈加燥热的气候，趁机取代了兽孔目成为了占主导地位的陆地脊椎动物[34]。蕨类植物也借机重新压倒裸子植物占据了陆地生态圈，后者直到安尼期早期才恢复元气。在中三叠世，海洋爬行动物（鱼龙、沧龙、鳍龙、海龙等）、辐鳍鱼、早期恐龙、翼龙和从幸存犬齿兽进化而出的哺乳形类相继出现。然而在2.32亿年前随着晚三叠世早期绵延200万年的卡尼期洪积事件，由木本植物组成的森林全面崛起成为全球范围的主流植被，拥有胃石、气囊-旁支气管系统和双足步行并更适应稠密木本植被环境的恐龙得到了辐射适应的机会，并在三叠纪—侏罗纪灭绝事件后取代了伪鳄成了陆上优势物种，从而在之后超过1.6亿年期间彻底主宰了中生代[35]。在约1.6亿年前的侏罗纪中后期，由兽脚亚目恐龙演化出的鸟翼类开始出现。然而在这个由恐龙与翼龙身影笼罩的世界里，使用皮肤上特化的汗腺——乳腺来分泌营养汁喂养幼崽的哺乳类也在生态系统下层暗自发展，并分化出了原兽类（单孔目的祖先）、后兽类（有袋类的祖先）和真兽类（胎盘类的祖先）三支。在1.25亿年前的白垩纪中期，随着以开花授粉形式繁殖的被子植物的兴起，能够传粉的昆虫也跟着共同演化，长年躲在森林中昼伏夜出的哺乳类、早期鸟类、小型爬行动物和小型两栖动物等有食虫/食果/食蜜习性的动物趁机一起出现了大规模辐射并逐渐占据了几乎所有的食物网中下层生态位。真社会性昆虫也在这个时期出现，最早的禾本目的草也出现在白垩纪后期。

随着6600万年前的白垩纪-古近纪灭绝事件造成了几乎所有大中型动物集群灭绝[36]，幸存的哺乳类、鸟类、爬行类（鳞龙类、龟类和鳄类）和滑体两栖类等小型动物在非鸟恐龙和翼龙灭绝后得以在体型和多样性上迅速增长[37][38]，从而成为新生代主流的陆生和半水生动物。在古近纪早期因为海洋爬行动物和菊石的集体灭亡，辐鳍鱼的数量和多样性迅速增加，很快便远超鲨鱼和鳐鱼等软骨鱼成为主流的海洋脊椎动物。在陆地上，因为大型植食动物灭绝，以阔叶树和松柏为主、但动物种类稀少的茂密丛林开始大量繁衍，树冠间的相互遮掩争夺阳光从而造成了树干变高变粗、果实变大并驱使附生植物的演化，随后使得更适应低光和树居环境的哺乳类和鸟类获得了大量新的生存环境。而5550万年前古新世—始新世极热事件带来的高温和大量降水使得森林的分布范围扩展到了极地，也让许多哺乳动物（特别是胎盘类和有袋类）得以迁徙到世界各地，绝大多数现代动物的分支（比如有蹄类、灵长类、啮齿类、翼手类、近蹄类等）也在这个时期出现，而最早的古鲸和海牛也开始向水生的方向演化。在4900万年前的始新世中期，地球气候开始变冷（被怀疑是满江红属的真蕨类漂浮植物在当时被白令陆桥封闭的北冰洋出现水华后沉淀海底造成的碳截存导致），各大陆内部区域开始干燥，季节变化也更加明显，这使得更能适应温差变化的落叶植物开始在维度更高的北半球大陆上取代常绿植物，原本覆盖陆地的茂密森林也大量被疏林草原取代。复杂的环境变化也使得哺乳动物的脑容量和智力开始增长，其中一些社会性动物——比如灵长类——则在端脑中演化出了更有利于交流协作的镜像神经元。在始新世晚期，以龙王鲸为代表的海洋哺乳动物已经压倒鲨鱼成为海中的顶级掠食者。而南美洲和南极洲大陆的最终分离使得南极绕极流形成，南极洲从此彻底变冷，其原有的阔叶林生物群系开始大片丧失变成了冻原，并在3390万年前开始形成永久性的冰盖。持续的全球变冷和海平面下降——很可能加上数次在北美东海岸切萨皮克湾出海口和西伯利亚波皮盖附近等地的陨石撞击——引发了3350万年前的始新世-渐新世灭绝事件，使得当时欧洲地区的特有物种被迁徙自亚洲地区的新物种大量取代，也使得在之后的渐新世出现了大片草原和适应平原环境食草生存的反刍动物，变冷造成的森林退缩也使得除非洲以外的灵长类（特别是新兴的类人猿）受到重创。海水的变冷浑浊使得古鲸种群衰落被能够回声定位的须鲸和齿鲸取代，半水生的鳍足类也在这个时期开始活跃在近海。

新近纪的生物群大部分已与现代无异。地球气候虽然在整体变冷的大趋势下出现数次回暖和重新变冷的反复，但在中新世早中期温度整体维持温暖，直到1400万年前突然爆冷，因而引发了中新世中期灭绝事件。随着1200万～920万年前北美洲和南美洲之间形成的巴拿马地峡切断了太平洋通往大西洋的暖洋流，使得两极温度进一步变冷，同时还造成了南北美洲生物大迁徙。印度次大陆和阿拉伯板块继续挤压亚欧板块形成的高山区、美洲西部山系的造山运动和东非高原的形成使得欧亚非大陆和北美洲的内部地区因雨影效应而产生极度的干燥气候，最终迫使非洲东部的一些人族猿类（比如湖畔南方古猿）在约420万年前的上新世早期放弃树居生活开始在平原上以直立行走的方式活动，因为不得不应对与其它大型地面食肉动物竞争的复杂环境，因而加速了新皮质的演化。开始使用石器的人属动物在约260万年前的上新世末期出现，开启了人类进入石器时代的演化序章。

在进入第四纪后，地球开始进入一系列小冰期和间冰期交替的持续冰河时期，使得亚寒带和凉温带都开始出现持久的大陆冰川，从而造就了适应低温演化的更新世巨型动物群。然而整个第四纪对生物圈最有深远影响的是人类演化史，最早进入旧石器时代的人属动物——旧石器早期的能人在约230万年前的更新世早期就开始在非洲使用砾石石器作为砍砸器。在约200万年前，使用燧石手斧的直立人出现并开始使用火，之后在更新世中期成功扩散到了欧亚非大陆南部各地。在约30万年前的更新世中期，使用更精制石器的早期智人在东非出现，人类也进入旧石器中期。与现代人在解剖学上无异的晚期智人出现在约20万年前，之后分两波向非洲外迁徙。智人的第一波扩散始于约13万年前，处于倒数第二次冰期消退后与末次冰期之间的间冰期。之后很可能因为约7.4万年前苏门达腊超级火山喷发造成了全球人类的种群瓶颈，只有未离开非洲的智人得以幸免并在约7万年前再次扩散到世界各地。而这第二波扩散全球的智人已经进入旧石器晚期并拥有了行为现代性和高度组织性，很可能加速导致了第四纪灭绝事件使得除了非洲以外各大洲的巨型动物群基本上全部灭绝，并让尼安德特人、丹尼索瓦人和佛罗勒斯人等剩余的早期人类绝迹。在2万年前末次冰盛期结束后，地球气候逐渐回暖，冰川退缩、海平面下降，但因为大型动物的凋零，人类转为更加泛化的狩猎采集，最早被驯化的犬类也开始出现，中石器时代开始。然而在约1.29万年前，北美中部的一个冰前湖——阿加西湖的东岸冰坝出现溃决，大量冰冷淡水直接流入北大西洋关闭了大西洋经向翻转环流，导致北半球大部分地区发生气候突变重新进入一个持续了约1200年的小冰期，史称新仙女木期，直到这个小冰期在约1.17万年前结束。

全新世的气候重新回暖并进入了一个气候稳定期，而进入了新石器时期的一部分人类开始定居并率先在黎凡特和两河地区大规模种植谷类作物和驯养牲畜。新石器革命带来的农业兴起使得人类的生存策略发生了根本性改变，以大型聚居地为核心的各地文明开始成型，书写文化、劳动力分工、手工业和冶金技术得以发展，最终使石器时代转型为铜石并用时代，并随后在约5000年前先后进入大规模使用铜器的青铜时代，文字记载也开始出现。在进入青铜时代的同时，人类也开始试验利用陨铁炼制铁器，最终在约3400年前开始使用铁矿，并在约3200年前的青铜时期晩期崩溃后普遍进入铁器时代。铁器时代后半部分的人类历史为有系统性记录的信史时期，分为（在现代通常以公元为纪元的）古代、后古代（中世纪）和开始大量使用火药的早现代。早现代时期是欧洲白人通过大航海时代向全球各地殖民的时期，这期间造成了大量的原住民被屠杀、奴役和文化灭绝。在18世纪中期欧洲人首次进入了依赖复杂动力机械的工业时代，逐渐引发了工业国之间以国家机器争夺资源和地缘影响力的霸权帝国主义，最终引发了以两次世界大战和冷战为代表的国际性军事同盟冲突，甚至有引发核战争的危险。而战争和对抗也反过来加速了人类科学技术（特别是电器）的发展，最终促使人类成为地球历史上唯一做到离开大气圈并探索外层空间的物种。但随着人类活动造成的过度捕捞、过捕狩猎、环境污染和栖息地破坏，造成了大量野生动植物集群灭绝——也就是至今仍在进行的全新世灭绝事件。

地球最早历史

地球及生命史
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地球与太阳系形成
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大碰撞形成月球
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地表冷却，产生海洋、大气
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后期重轰炸期
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生命起源（－41亿年前）
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大氧化事件
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最早的多细胞生物[39][40]
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已知最早的真菌
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已知最早的刺胞动物
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寒武纪大爆发
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最早的陆生脊椎动物
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已知最早的恐龙
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非鸟恐龙灭绝
单位：百万年
主条目：地球历史

在地球上发现的最古老的陨石碎片约有45.4亿年的历史。再加上对古铅矿为主的定年，估计地球大约形成于那个时候。[41]月球的成分基本与地球地壳相同，但没有像地球那样富铁的核心。许多学者认为，地球在形成后约4000万年，与一个火星大小的星体相撞，将形成月球的地壳物质抛进轨道。另一个假设是，地球和月球同时形成，但地球的引力比月球强得多，几乎吸引到了所有的铁微粒。[42]

直到2001年在地球上发现的最古老的岩石约有38亿年历史，[43][41]这误导科学家估计那之前地表一直是熔融的。他们据此将这段地球史称作冥古宙。[44]然而，对44亿年前形成的锆石的分析显示，地球地壳在地球形成后约1亿年就已经凝固了，而且地球很快就获得了海洋和大气，可能已经能够支持生命。[45][46][47]

来自月球的证据表明，40到38亿年前它遭受了太阳系形成时留下的碎片的后期重轰炸期，地球的引力更强，应当遭受了更强烈的撞击。[44][48]虽然没有直接证据能表明这时地球的地表状况，但也没有理由认为地球没有受到影响。[49]来自彗星撞击的气体和水可能彻底取代了之前的任何大气或海洋，地球上火山释气也至少提供了一半的贡献。[50]如果此时地下已经出现了生命，它应在轰炸期幸存了下来。[51]

地球上生命的最早证据

得到确认的最早生命体十分微小，也没什么特征，化石看起来像小棒子，很难与非生物过程产生的结构区分开来。无可争议的最古老的生命证据是细菌化石，定年为30亿年前。[52]35亿年前的岩层中的发现被解释为细菌[53]，地球化学证据似乎也显示38亿年前存在生命。[54]然而，对这些分析进行的严格审查表明，非生物过程也可以产生所有见诸报告的“生命证据”。[55][56]虽然这证明不了所有“生命证据”都来自非生物过程，但也证明不了所有“生命证据”都来自生命过程。34亿年前的沉积岩中的地球化学特征被解释为生命的证据，[52][57]但这些说法尚未得到批评者的充分研究。

加拿大魁北克省努夫亚吉图克绿岩带中发现了37.7－42.8亿年的疑似微生物化石，[16]但因证据不足存在争议。[58]

地球上生命的起源

更多信息：演化的证据、共同起源和同源

生物学家推测，地球上所有生物都必然有一个单一的最后共同祖先，因为多个起源几乎不可能独立演变出所有生物共有的许多复杂生化机制。[59][60]

地球独立起源

主条目：生命起源
更多信息：涌现

地球生命以碳与水为基础。碳为复杂化学物质提供了稳定的框架，且从环境中的二氧化碳中可以很容易地提取出来。[47]碳的化学特性鹤立鸡群，没有另一种能与它比拟：元素周期表上碳紧下方的硅不能形成像碳那么多的复杂稳定大分子，且其化合物大都不溶于水；且与二氧化碳相比，二氧化硅在能支持生物的温度下是一种坚硬耐磨的固体，对生物来说更难利用。硼和磷拥有更复杂的化学性质，但相比于碳还是受到不少限制。水是一种出色的溶剂，还有另外两个特性：冰能漂在水上，这使得水生生物能在冬天水体部分结冰的环境下也能生存；其分子存在极性，能溶解的物质比其他溶剂更多。氨等溶剂只有在低温下才是液态的，化学反应可能过于缓慢，无法维持生命，也没有水的其他优势。[61]不过，基于假定型生物化学的生命体在其他星球上可能也存在。[62]

关于生命如何从化学物质中产生的研究集中在三个可能的出发点上：自我复制，即生命体产生与自己非常相似后代的能力；新陈代谢，即养活并修复自己的能力；细胞膜，即允许食物进入、废物离开，并与不需要的环境相分割的能力。[63]关于生命起源的研究还有很长的路要走，因为这方面的理论和经验证据才刚开始接触。[64][65]

繁殖在先：RNA世界

主条目：最后共同祖先和RNA世界学说

现代三域系统中最简单的生命也使用DNA记录遗传信息，一系列RNA和蛋白质分子则负责“阅读”这些指令，并将其用于生长、维护与繁殖。一些RNA分子可以催化自身复制和蛋白质构建，这一发现说明早期生命形式可以完全基于RNA。[66]这些核酶可能形成了一个RNA世界，其中有个体但尚无物种，因为突变和基因水平转移意味着每个后代都可能具有和父母本不同的基因组。[67]RNA后来被DNA取代，后者更稳定，能构建更大的基因组，进而延拓了单个生命体的能力范围。[67][68][69]核糖酶仍是核糖体的主要组成部分，后者是现代细胞的“蛋白质工厂”。[70]证据表明，地球上最早的RNA分子诞生于41.7亿年之前或更早。[71]

虽然实验室里已经人工生产出了能自我复制的短RNA分子，[72]RNA能否经由自然过程自动合成仍无人知悉。[73]最早的“核酶”可能是由较简单的核酸，如PNA、TNA、GNA等形成的，后来被RNA取代。[74][75]

2003年有人提出，多孔金属硫化物沉淀可在海底热泉约100°C的环境和洋底压力下催化RNA合成。根据这一假设，脂类膜会是最后出现的主要细胞成分，在此之前原初生命体会被限制在孔隙中。[76]

代谢在先：铁–硫世界

主条目：铁硫世界学说

1997年开始的一系列实验表明，硫化亚铁和硫化镍作催化剂，可以实现从一氧化碳和硫化氢等无机材料到蛋白质前体的转化。大多数步骤需要大约100°C的温度和适度的压强，其中有一步需要250°C的温度和7km岩石下的压力。因此，有人认为蛋白质的自我维持合成可能发生在海底热泉附近。[77]

外膜在先：脂质世界

  = 脂质分子亲水端
  = 疏水端
脂质体截面图

有人认为细胞外膜双重气泡样的脂质可能是必不可少的第一步。[78]模拟早期地球条件的实验报告了脂质的形成，它们可以自发地形成脂质体、双层“气泡”，并进行自我繁殖。[47]虽然它们不像核酸那样是内在的信息载体，但也会受到寿命与繁殖的自然选择。RNA等核酸可能在脂质体内部更容易合成。[79]

黏土假说

主条目：RNA世界假说

RNA很复杂，人们怀疑它能否在野外以非生物方式产生。[73]蒙脱石为代表的黏土具有加速RNA世界形成的特性：它们通过结晶模式自我复制；受类似于自然选择的机制影响，特定环境中生长最快的黏土“物种”会迅速成为主导；可以催化RNA分子的形成。[80]:57–66虽然这一观点没有成为科学界的共识，但仍有积极的支持者。[81]

2003年的研究称，蒙脱石还可以加速脂肪酸转化为“气泡”的过程，它可以包裹附着在黏土上的RNA，还可以通过吸收额外的脂质而“成长”与分裂。最早的细胞的形成可能有着类似过程的帮助。[82]

一个相似假说认为可自我复制的富铁黏土是核苷酸、脂质与氨基酸的先驱。[83]

源自别处说

主条目：胚种论

胚种论没有解释生命最初是如何产生的，只是提到了生命源自地外的可能性。地球生命源自宇宙其他地方的“播种”的想法至少可以追溯到公元前6世纪的古希腊哲学家阿那克西曼德。[84]20世纪又由物理化学家斯万特·阿伦尼乌斯、[85]:32天文学家弗雷德·霍伊尔、钱德拉·维克拉玛辛赫（Chandra Wickramasinghe）、[86]分子生物学家弗朗西斯·克里克、化学家莱斯利·奥格尔（Leslie Orgel）重新提出。[87]

这种假说有三个主要版本：

  1. 从太阳系其他地方通过小行星撞击产生的碎片进入太空、到达地球，此说最可能的生命来源是火星[88]或金星[89]；
  2. 外星人带来，可能是他们带来的微生物意外发生星际污染的结果；[87]
  3. 来自太阳系外，经自然手段带来。[85][88]

EXOSTACK等低地球轨道上进行的试验已经证明，一些微生物孢子可在被弹射到太空中的冲击中存活下来，有些可以在外太空辐射下存活至少5.7年。[90][91]科学家们对火星[92]或银河系其他行星上独立产生生命的可能性存在分歧。[88]

菌毯对环境与演化的影响

主条目：微生物席和大氧化事件
 
西澳大利亚州鲨鱼湾的现代叠层石

菌毯是多层、多种细菌及其他物种共生组成的生物群落，一般只有几毫米厚，但仍蕴含丰富的化学环境，每种环境都利于不同的微生物生存。[93]每个垫层都在某种程度上形成了自己的食物链，因为每组微生物的废弃物通常都是相邻组的“食物”。[94]

垫层中的微生物为避免水带来的沉积物活埋它们，慢慢向上迁移，形成的粗壮的柱子便是叠层石。[93]对于30亿年前再往前的所谓化石的可信度一直有激烈的争议，[95]批评者指出地层中类似于叠层石化石的结构也可能由非生物过程形成。[55]2006年，在澳大利亚同一地区，又发现了35亿年前之前的岩石中存在叠层石。[96]

现代菌毯中，顶层常常由可以光合作用的蓝菌组成，它们创造了菌毯上部的富氧环境。菌毯底部无氧，气体以厌氧菌排放的硫化氢等为主。[94]据估计，菌毯中细菌含氧光合作用的出现使得生物生产力提高了100至1000倍。含氧光合作用所用的氢原子来自水，它比早期非含氧光合作用所需要的地质运动产生的还原剂丰富得多。[97]从这时开始，生命生产的资源就明显躲过了地球化学过程所产生的。[98]氧气对不适应它的生命来说是剧毒的，但由于其极高的化学能[99]，又大大提高了适应了氧气的生物的代谢效率。[100][101]大约24亿年前开始，氧气逐渐变为地球大气层的主要组分之一。[102]虽然真核生物可能出现得比这早，[103][104]但大气层含氧量是复杂真核细胞进化的先决条件，而所有多细胞生物都是由真核细胞构成的。[105]夜间光合作用停止后，菌毯中富氧-无氧界会上移，第二天天亮后会下移。这会对中间区域的生物施加演化压力，使它们通过内共生之类手段耐受并学会利用氧气。“内共生”指一种生物活在另一种生物体内，且两者都从这种共生中受益。[18]

在菌毯中，蓝菌拥有最齐全的“工具包”，是最能自给自足的菌毯生物，既能供养菌毯，也能为浮游植物奠基，支撑海洋食物网的大部分。[18]

真核生物的多样化

真核生物
多貌生物
 

原始色素体生物（有胚植物、绿藻、红藻、灰藻）

 
 

定鞭隐藻生物（英语：Hacrobia）

 
 

SAR超类群（原生藻菌（英语：Stramenopile）、囊泡虫、有孔虫界）

 
 
 

古虫界

 
单鞭毛生物
 

变形虫界

 
 

无根虫门（英语：Sulcozoa）

 
后鞭毛生物
 

动物

 
 

真菌

 
 
 
 
真核生物可能的演化树之一[106][107]
主条目：真核生物

染色质、细胞核、内膜系统和线粒体

真核生物可能在大气含氧量剧增之前就存在了，[103]但现代绝大多数真核生物都需要氧气，其化学能[99]被线粒体用于生产三磷酸腺苷，后者是所有已知细胞的内部能量来源。[105]1970年代有人率先提出，真核生物是原核生物间系列内共生的结果，经过广泛的讨论，目前人们已经接受了此观点：例如，捕食性微生物入侵了一个大型原核生物，如古菌，但攻击被化解。于是入侵者住了下来，演化为线粒体；这些嵌合体的其中一个后来试图吞下可光合作用的蓝藻，但蓝藻没能被消化，幸存者演化为叶绿体，成为植物的祖先；诸如此类。每次内共生开始后，两方都会重排自己的基因组，以消除无益的重复性状，这有时涉及基因在两者间的转移。[108][109][110]另一种假说认为，线粒体最初是代谢硫或氢的内共生生物，后来转为耗氧。[111]另一方面，线粒体也可能是真核生物的原始细胞器之一。[112]

真核生物首次出现的时间存在争议：澳洲页岩中的甾烷可能说明27亿年前就已经存在；[104]然而2008年一项分析认为，这些化学物质渗入岩石的时间不到22亿年，不能证明真核生物的起源。[113]18.5亿年前的岩石中发现的卷曲藻属（英语：Grypania）化石（最初定年为21亿年前，后来修正[23]）表明，带有细胞器的真核生物在那时就已经演化出来。[114]15-14亿年前的岩石中发现了多种藻类化石。[115]真菌最早的化石来自14.3亿年前。[116]

色素体

色素体是一大类细胞器，最知名的是叶绿体，可能起源于内共生的蓝细菌。这种共生关系源于约15亿年前，使真核生物能进行含氧光合作用。[105]此后出现了三种不同光合作用质体的演化支：绿藻与植物的叶绿体、红藻的藻红体（英语：rhodoplast）、灰藻的灰质体。[117]在色素体这种初级内共生出现后不久，藻红体和叶绿体被传递给其他双鞭毛生物，到新元古代末成功诞生了真核浮游植物。

有性生殖与多细胞生物

有性生殖的演化

主条目：有性生殖的演化和有性生殖

真核生物有性生殖的决定性特征是减数分裂与受精，这种繁殖中有很多基因重组，后代从父母双方各获得50%的基因，[118]而无性生殖没有基因重组的过程。细菌也会通过接合交换DNA，它们可以以此传播抗生素抗药性以及利用其它代谢产物的能力。[119]然而接合不是繁殖方式，也不限于同一物种——甚至有细菌将DNA转移到动植物身上的例子。[120]

另一方面，细菌转化显然是在同一种细菌间转移DNA的一种适应。细菌转化涉及众多细菌基因的产物，可视作一种细菌形式的有性生殖。[121][122]这一过程至少在67个原核生物物种（分属7个门）中自然产生。[123]真核生物的有性生殖可能就来自细菌的转化。[124]:1–50

有性繁殖的缺点众所周知：基因重组可能破坏有利的基因组合；由于雄性不能直接增加下一代的数量，无性繁殖种群可以在短短50代以内取代其他方面都相等的有性繁殖种群。[118]但绝大多数动物、植物、真菌、原核生物都采用了有性生殖。有强有力的证据表明，有性繁殖几乎是伴随着真核生物一同出现的，控制它的基因从那时起就变化不大。[125]时至今日，有性生殖的起源与存续仍是个开放问题。[126]

 
Horodyskia可能是一种早期后生动物，[23]或仅是一个有孔虫门菌落。[127]随沉积物在其底部周围沉积得越来越深，它重新排列为较大的菌块。[23]

红皇后假说认为，有性繁殖为寄生虫提供保护，因为寄生虫更容易演化出克服基因相同的克隆体的防御手段，而不是因繁殖时基因重组导致两代间有基因差别的有性物种的防御手段，且有实验证据支持。但有性繁殖能否在存在多个相似无性物种的环境下获得竞争优势仍然存疑：其中一个无性物种可能偶然可以耐住寄生虫并存活足够长的时间，从而在繁殖上超过有性物种。[118]另外，凯瑟琳·汉利（Kathryn A. Hanley）等人发现，与红皇后假说的预测相反，有性壁虎的螨虫流行率、丰度和平均强度明显高于同一栖息地的无性壁虎。[128]而且，生物学家马修·帕克（Matthew Parker）在查阅大量关于植物抗病性的研究有，未能发现一种以宿主有无性别为易感条件的病原体。[129]

阿莱克谢·孔德拉绍夫（Alexey Kondrashov）的确定性突变假说（Deterministic Mutation Hypothesis，DMH）假设每个生物都有多个有害突变，这些突变的综合影响比每个单独突变的危害之和更有害。这样，基因重组将减少不良突变对后代的伤害，同时将不良突变隔离在因不良突变数量高于平均水平而迅速死亡的个体中，从而将不良突变从基因库中消除。然而证据表明DMH假说不可靠，许多物种每个个体的有害突变平均不到一个，而且没有一种被调查的物种显示有害突变存在任何协同效应。[118]

有性生殖基因重组的随机性导致性状的相对丰度存在代际变化。这种遗传漂变本身并不足以使有性繁殖变得有利，但和自然选择结合起来时就足以产生足够的选择压了。突变产生良好性状组合时，自然选择会给在遗传上与这些性状有关的品系以相当的优势。另一方面，良好性状会被有害性状中和，而有性生殖的基因重组能使良好性状与其他良好性状相联系，数学模型表明这可能足以抵消有性繁殖的缺点。[126]其他本身不甚充分的假说组合也在研究之中。[118]

下列假说试图解释性别何以演化出来：

  • 可能使生物体得以修复基因损伤。[130]最原始的有性生殖形式可能是一个生物体复制一个类似生物体的未受损伤的链，以此修复受损的DNA。[131]
  • 可能源于自私的寄生遗传元素，通过转移到新的宿主身上实现自我繁殖。[132]
  • 可能从同类相食行为发展而来，受害者的DNA被纳入捕食者体内。[131]
  • 可能源自盐杆菌纲转座子与质粒的交流。[133]
  • 可能来自类似于疫苗接种的过程，受感染的宿主提供寄生虫DNA的共生副本，以便对抗寄生虫。有性繁殖减数分裂阶段可能来自去除共生体的一种方式。[134]

性的适应功能在近日仍是个亟待解决的重要问题。约翰·伯德塞尔（John A. Birdsell）和克里斯托弗·威尔斯（Christopher Wills）回顾了解释性的适应功能的各种模型。[135]:27–137

多细胞生物

主条目：多细胞生物

最简单的“多细胞”生物就是“有多个细胞”，可以包括像念珠藻属这样的蓝细菌菌落。“具有相同基因组但表现性状不同”这样的定义，也可以包括团藻的部分属，它们有一部分细胞专门用于繁殖。[136]海绵、其他动物、真菌、植物、褐藻、蓝藻粘菌及粘球菌目的多细胞性均是独立演化出来的。[137]为简洁起见，本文重点介绍细胞分化程度最高、细胞类型最丰富的生物，尽管这种处理生物复杂性的演变的方法可能被视作“人类中心主义”。[24]

 
正通过迷宫的粘菌。粘菌（黄色）探索并填充了迷宫（左侧）。研究人员将糖（红色）放在两个分开的点上时，粘菌将自身质量大部都集中在那里，只留下两点间最直接的连接路径。[138]

多细胞最初的优势可能包括：更有效地分享在细胞外消化的营养物质；[139]捕食者多数采用吞噬来攻击，多细胞化可以增加对抗捕食者的能力；通过附着在坚硬表面抵抗水流；向上延伸以过滤食物或获得阳光进行光合作用；[140]创造隔绝于外部环境的内部环境；[24]使一群细胞分享信息从而表现得很“聪明”。[138]这些特征也会为其他生物提供机会，通过创造比扁平的菌毯更多样的环境促进多样化。[140]

具备细胞分化的多细胞生物对生物体整体来说是有利的，但从单个细胞的角度来看是不理的，因为大多数细胞失去了自我繁殖的机会。无性多细胞生物中，保留繁殖能力的细胞可能会使整个生物体重回一团未分化的细胞并死亡或散开，而有性繁殖能消除这种“流氓细胞”，因而有性繁殖似乎是复杂多细胞物种诞生的必要条件。[140]

现有证据表明，真核生物演化出来要早得多，但在10亿年前左右的快速多样化之前一直不甚起眼。真核生物唯一明显优于细菌和古菌之处在于其形态上的多样化能力，有性繁殖使真核生物能利用这一优势，产生形态功能不同的多细胞生物体。[140]

科学家通过比较单、多细胞生物的转录因子和调控网络结构的组成，发现多细胞生物中有许多新的转录因子和三种新的调控网络结构，而且新的转录因子优先与这些新的结构相关联，这对多细胞的发育至关重要。这些结果为新型转录因子和新型网络结构在转录调控水平上对多细胞生物的起源的贡献提出了一个合理的机制。[141]

化石证据

定年结果显示为21亿年前的弗朗西维利安生物群化石是已知最早的多细胞生物化石群，[40]它们可能已经具备了分化的细胞。[142]17亿年前的青山虫（Qingshania）似乎由几乎相同的细胞组成。12亿年前的红毛菜纲多细胞红藻（Bangiomorpha）是已知最早的有专门分化细胞的生命体，也是最早的有性繁殖生命体。[140]14.3亿年前被解释为真菌的化石似乎也是具有分化细胞的多细胞生物。[116]15－9亿年前的岩石中发现的“珠串”生物Horodyskia可能是早期的后生动物，[23]也可能是有孔虫菌落。[127]

动物的涌现

更多信息：动物、埃迪卡拉生物群、寒武纪大爆发和冠群 § 干群
   
   
   
   
两侧对称动物
   
 

后口动物（脊索动物、半索动物门、棘皮动物）

 
原口动物
   

蜕皮动物（节肢动物、线虫动物门、缓步动物门等）

 
   

冠轮动物（软体动物、环节动物门、腕足动物门等）

 
 
 
   

无腔动物

 
 
 

刺胞动物门（水母、海葵、珊瑚）

 
 

栉水母

 
 
 

扁盘动物门

 
 

海绵：钙质海绵纲

 
 
 

海绵：六放海绵纲&寻常海绵纲

 
 
 

领鞭毛虫

 
 

中菌动物纲（英语：Mesomycetozoea）

 
 
动物的演化树[143]

动物是多细胞真核生物，[note 1]与植物、藻类、真菌的区别是没有细胞壁。[144]所有动物都是可移动的[145]。海绵以外的所有动物身体都分化为不同组织，如骨骼肌、神经系统，前者通过收缩使动物得以运动，后者负责信号的传递与处理。[146]:28–572019年11月，研究人员报告称，在6.09亿年前的岩石中发现了介于动物和非动物之间的多细胞生物笼脊球属（英语：Caveasphaera）的化石，可能与动物最初的演化有关。[147][148]对笼脊球属的化石研究表明，类动物胚胎发育要比明确的最古老动物化石早得多，[147]可能与研究表明的动物进化始自约7.5亿年前相一致。[148][149]

被广泛接受的最早的动物化石看起来很像今日的刺胞动物门（含水母、海葵、水螅），可能形成于5.8亿年前。陡山沱组（英语：Doushantuo Formation）化石的定年并不精确。它们的出现意味着刺胞动物已经和两侧对称动物发生了分化。[150]

埃迪卡拉生物群在寒武纪之前的4000万年里非常繁盛，[151]是第一批超过几厘米长的动物。许多动物都是扁平的，具有被子状外观，以至于有人提议将它们归入一个单独的界——凡德生物界（英语：Vendozoa）。[152]还有一些被归入软体动物（金伯拉虫[153][154]）、棘皮动物（海座星[155]）与节肢动物（斯普里格蠕虫[156]、Parvancorina[157]）。对于这些化石的具体分类仍有争议，主要是现在供分类用的特征在那时大都还没演化出来。无疑的是，金伯拉虫是至少有三个胚层的两侧对称动物，明显比刺胞动物更复杂。[158]

小壳动物群（英语：Small shelly fauna）是晚埃迪卡拉世至苗岭世发现的非常混合的化石集合。最早的克劳德管科（英语：Cloudinid）显示出成功抵御捕食的迹象，可能表明进化军备竞赛的开端。寒武纪初一些微型贝壳几乎可以肯定属于软体动物，而“盔甲板”的主人——哈氏虫（英语：Halkieriid）与微网虫（英语：微网虫）——则在保存了软体动物的寒武纪地层中发现了更完整的遗迹，最终被确定下来。[159]:67–78

 
欧巴宾海蝎为现代人产生对寒武纪大爆发的兴趣起了不可磨灭的作用。[160]:124–136

1970年代，因为前寒武纪动物化石奇缺，人们开始讨论现代生物各门的出现是“爆炸性”的还是渐进的。[159]对伯吉斯页岩化石的重分析发现了欧巴宾海蝎等不属于任何已知门类的动物，使人们对这个问题更加感兴趣。当时这些化石被解释为现代门类在寒武纪大爆发中进化得非常迅速的证据，而伯吉斯页岩的“怪异表现”说明，寒武纪初是动物进化史上可谓空前绝后的实验时期。[160]后来对类似动物的发现及新理论方法的发展产生了这样的结论：许多“奇怪的奇迹”实际上是现代生物门类的“表亲”[161]—例如，欧巴宾海蝎所属的叶足动物中包含了节肢动物的祖先，可能与现代的缓步动物关系密切。[162]关于寒武纪大爆发是否真的是“爆发”、它是如何发生的、为什么在动物演化史上独一无二，仍有很多争论。[163]

后口动物与第一批脊椎动物

 
棘鱼纲是第一批进化出颚的脊椎动物之一。[164]
主条目：脊索动物

寒武纪大爆发之争核心的动物大多都是原口动物，是复杂动物的两个主要分支之一。另一支叫后口动物，包含海星、海胆等无脊椎动物，及脊索动物（下详）。许多棘皮动物都有坚硬的方解石“外壳”，这在早寒武纪小壳动物群中相当常见。[159]其他后口动物身体柔软，大多数重要的寒武纪后口动物化石都来自中国澄江动物群。[165]脊索动物是另一支重要的后口动物分支，指具有明显背神经索的动物。脊索动物包括软体的无脊椎动物，如被囊动物亚门，以及脊椎动物—有脊椎的动物。被囊动物化石可追溯回寒武纪大爆发，[166]但澄江动物群中的海口鱼和丰娇昆明鱼似乎是真正的脊椎动物，[30]海口鱼有明显的椎骨，可能发生轻微生物矿化。[167]棘鱼纲等有颌脊椎动物，首次出现在晚奥陶世。[168]志留纪兰多维列世有颌脊椎动物发生第一次辐射演化[169][170][171]。

登陆

适应陆上生活是个重大挑战：所有陆生生物都要对抗干燥，所有超过微观尺寸的生物都必须创造特殊结构以对抗重力，呼吸和气体交换系统也必须革新，生殖系统也不能再依靠水携带卵与精子。[172]:120–122[173][174]最早的陆生动植物的良好证据可以追溯到奥陶纪（4.88－4.44亿年前），且一些微生物更早时候就已经登上了陆地，[175][176]现代陆地生态系统则迟至晚泥盆世，3.85－3.59亿年前才产生。[177]2017年5月，西澳大利亚州皮尔巴拉克拉通（英语：Pilbara Craton）34.8亿年前的硅华（英语：Geyser）及其他有关矿藏（温泉和间歇泉周围常见）中，发现了已知最早的陆上生命的证据。[178][179]2018年7月，科学家报告说，陆上最早的生命可能是32.2亿年前的某种细菌。[180]2019年5月，科学家报告说加拿大北部新发现一种真菌化石Ourasphaira giraldae，可能在10亿年前就已经在陆地上生长了，这远早于植物在陆地上生活的时间。[181][182][183]

陆上抗氧化手段的演变

5亿年前动植物开始进入河流和陆地时，海洋矿物质抗氧化剂大环境不复存在，是对陆地生命进化的挑战。[184][185]

实际上，被子植物（当今最主要的植物种类）和它们的大部分抗氧化剂都产生于晚侏罗世。植物用各种抗氧化剂保护它们的结构免受光合作用中产生的活性氧类影响。动物也直接暴露在同样的氧化剂中，它们已经进化出了内源抗氧化酶系统。[186]碘离子I-是海陆生物饮食中最原始、最丰富的富电子元素，作为电子供体在从原始海洋藻类到陆地脊椎动物的几乎所有生物体重都充当着抗氧化剂。[187]

土壤的演化

土壤指矿物微粒与分解的有机物质的组合，在生物登陆之前尚不存在。地表要么是裸露的岩石，要么是风化作用产生的沙子。水和营养物质都会很快消失。[177]以瑞典次寒武纪准平原为例，新元古代风化作用形成的高岭土最大深度约为5米，相比之下中生代形成的高岭土矿床要厚得多。[188]有人认为，因为陆上缺乏植物，新元古代末的地表侵蚀以片状侵蚀（英语：Sheet erosion）为主。[189]

 
混凝土上的地衣

蓝细菌虽然不是植物，但应用着相同的光合作用机制。现代沙漠等不适合维管植物生长的地方还分布着蓝细菌薄膜，这说明菌毯可能是第一批在干燥的陆地上定居的生物，可能前寒武纪就已经如此。形成菌毯的蓝细菌在从海洋向潮间带扩张，进而登陆的过程中，可能逐渐演化出了对抗干燥的能力。[177]地衣是一种真菌（几乎总是子囊菌门）和光合作用者（绿藻或蓝菌）共生的组合，[190]也是无生命环境的重要“殖民者”，[177]它们可以分解岩石，有助于在植物尚无法生存的环境中实现成土。[190]已知最早的子囊菌化石出现在4.23－4.19亿年前的志留纪。[177]

在能钻地的动物出现之前，土壤形成得非常慢。动物可以混合土壤的矿物质和有机质，其粪便是有机质的重要来源。[177]奥陶纪沉积物中已经发现了环节动物或软体动物钻出的洞。[177][191]

植物及晚泥盆世树木危机

 
志留纪维管植物顶囊蕨复原图
 
中泥盆世基利波化石丛林（英语：Gilboa Fossil Forest）的树化石

水生藻类几乎所有细胞都能独立进行光合作用。陆上的环境要求植物的内部变得更复杂、专门化：光合作用在顶部最有效率；为从地下提取水，要有根；两者间要有支撑自身重量的支撑系统及水与养分的运输系统。[172][192]

4.76亿年前的中奥陶世岩石中发现了陆地植物的孢子，可能属于地钱门。4.3亿年前志留纪文洛克世的岩石中，已经发现了石松门植物化石，如巴拉曼蕨属。它们大都矮于10 cm，有些似乎已经具备了维管植物的形态。[192]

到3.7亿年前的晚泥盆世，古蕨属的树木是如此之多，以至于它们牢牢束缚着土壤的根将原先辫状河占主导的陆地河流系统改造成了曲流。[193]它们造成了“晚泥盆世树木危机”[194]：

  • 它们从大气中带走了更多二氧化碳，削弱了温室效应，在石炭纪引发了大冰期。[31]后来的生态系统中，“锁在”树木中的二氧化碳通过枯木的分界回到大气中。但能分解木材的真菌的最早化石证据也来自晚泥盆世。[195]
  • 植物根系越来越深，导致更多养分被雨水与河流冲刷入海，引发水华，消耗大量氧气，造成深水区的缺氧事件，引发部分深海物种灭绝。[31]

陆地无脊椎动物

动物不得不改造自己的进食和排泄系统，大多数陆地动物还演化出体内受精。[174]水和空气折射率的差异推动眼睛的演化。运动和呼吸变得更容易了一些，空气中高频声音的传播催生了听觉。[173]

 
各动物门对物种总数的相对数量。线虫动物门是拥有最多生物个体的门类，而节肢动物则有最多的物种数量。

已知最古老的呼吸空气的动物是中志留世428 Ma的原多足总目（英语：Archipolypoda）呼气虫。[196][197]它呼吸空气的陆生性质可通过气孔的存在得以证明。[198]4.9亿年前一些寒武纪-奥陶纪交界处的遗迹化石被解释为大型两栖节肢动物在沿海沙丘上的足迹，可能属于直蟹纲（英语：Euthycarcinoidea）物种，[199]在进化上相当于多足类的“姑姑”。[200]4.45亿年前晚奥陶世以上的其他遗迹化石可能来自陆地无脊椎动物，且有明确证据表明，4.15亿年前，在志留纪-泥盆纪边界之前不久，海岸和冲积平原上已经有了许多节肢动物，还有节肢动物吃植物的迹象。[201]节肢动物很好地扩展适应了陆上生活，它们现有的有节外骨骼提供了防止干燥的保护，对重力的支撑，以及不依赖于水的运动方式。[174][202]:126

其他主要无脊椎动物类群在陆地上的化石记录很稀少：非寄生性扁形动物门、线虫动物门和纽形动物门的完全没有；一些寄生性线虫可见于琥珀；环节动物化石自石炭纪开始出现，但可能仍是水生的；腹足纲陆上化石自晚石炭世开始出现，可能要等到植物凋落物足够丰富才能登陆。[173]

飞行昆虫最早的化石也来自晚石炭世，但昆虫很可能在早石炭世甚至晚泥盆世就演化出了飞行能力。这使它们有更多可以觅食繁衍的生态位，以及躲避捕食者和环境中不利变化的手段。[203]:155–160现代昆虫物种约99%都会飞，或是会飞物种的后代。[203]:12

早期陆地脊椎动物

主条目：四足类
 
棘石螈属（棘螈）改变了人们对四足类早期演化的看法。[204]
“鱼”
 

骨鳞鱼目（英语：Osteolepiformes）

 
 
 

希望螈目

 
 
 

奥氏螈属（英语：Obruchevichthys）

 
 
 

棘石螈属

 
 
 

鱼石螈属

 
 
 

图拉螈属（英语：Tulerpeton）

 
 
 

早期迷齿亚纲

 
 
 

石炭蜥目

 
 

羊膜动物

 
 
 
 
 
 
 
 
 
四足类演化树[205]

四足类是具有四肢的脊椎动物，在晚泥盆世（3.7－3.6亿年前）从其他扇鳍类鱼类演化而来。[206]早期类群被归为迷齿亚纲。它们保留了水生的鱼苗样蝌蚪，仍可见于今日的滑体亚纲。

碘和T4/T3刺激了两栖动物的蜕变与神经系统的演化，将水生素食蝌蚪转变为“更进化的”陆生肉食青蛙，具备更优良的神经系统、视觉空间、嗅觉和认知狩猎能力。[184]T3新的激素作用是通过在脊椎动物细胞中形成T3受体实现的。首先，约6－5亿年前，原始脊椎动物中出现了用于变态发育的αT3受体；约2.5－1.5亿年前，鸟类和哺乳动物体内又出现了具有代谢、产热作用的βT3受体。[207]

1950年代到1980年代初，人们都认为四足动物是由可能是为了在水塘间迁移而能在地上爬行的鱼类演化而来。然而1987年发现的3.63亿年前近乎完整的棘石螈属化石表明，这种晚泥盆世过渡动物既有腿，也有肺和鳃，但还不太可能在地上生存：它四肢腕踝关节太弱，承受不了自重；它的肋骨太短，无法防止肺被重力压成扁平状；鱼一样的尾鳍会因在地上拖动而损坏。目前的假设是，长约1米的棘石螈是一种完全水生的掠夺者，它一般在浅水区捕食，埋伏时用四肢抓紧植物。它的骨骼也与大多数鱼类不同，这使它能在身体被淹没的情况下抬头呼吸空气：它的下颌使其可以“吞咽”空气；它投顾后面的骨头融合在一起，为抬头用的肌肉提供有力的连接点；头部不与胸带直接相连，而是有明显的脖子。[204]

泥盆纪陆生植物的扩张可能利于解释为什么呼吸空气会成为演化优势。落入河流的树叶会促进水生植被的生长；这会吸引素食无脊椎动物和捕食它们的小鱼；它们是有吸引力的猎物，但这环境并不适合大型海洋捕食性鱼类；因为这些水域会缺少氧气，温水的溶解氧比冷的海水少，而且植被的分解会使用一些氧气，由此，直接呼吸空气成为一种近乎迫不得已的选择。[204]

后来的发现表明，棘石螈和完全类似鱼类的动物之间还有更早的过渡形式。[208]倒霉的是，四足类祖先的化石和中石炭世似乎完全适应了陆地生活的脊椎动物化石间有一个大约3000万年的空缺期（柔默空缺），这一时期只发现了很少量的化石，其四肢末端分为五个趾，说明真四足类是在约3.5亿年前的空缺中间演化出来的。空缺后一部分化石所属的动物看起来像是现代两栖动物的早期品种，有保持皮肤湿润、在水中产卵的特征；另一些化石则具备羊膜动物的特征，其防水的皮肤和卵膜使它们能远离水生活与繁殖。[205]石炭纪雨林崩溃事件可能为羊膜动物胜过两栖动物铺平了道路。

恐龙、鸟类、哺乳类

羊膜动物
合弓纲
 

早期合弓纲动物（已灭绝）

 
盘龙目
 

已灭绝盘龙目物种

 
兽孔目
 

已灭绝兽孔目物种

 
哺乳形类
   

已灭绝哺乳形类物种

 
   

哺乳动物

 
 
 
 
 
蜥形纲
 
 

无孔亚纲；龟是否归这里有争议[209]

 
   
 

大鼻龙科及原古蜥科（灭绝）

 
双孔亚纲
 

纤肢龙目（灭绝）

 
   
   

有鳞目（蜥蜴与蛇）

 
主龙类
 

已灭绝主龙类

 
 

鳄目

 
   
 

翼龙目（灭绝）

 
恐龙
 
兽脚亚目
   

已灭绝
兽脚类

 
   

鸟类

 
 
 

蜥脚亚目
（灭绝）

 
 
   

鸟臀目（灭绝）

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
恐龙、鸟类与哺乳类的可能演化树[210][211]

羊膜动物的卵可以保存在干燥的环境中，可能出现于晚石炭世（3.3亿年前）。羊膜动物合弓纲和蜥形纲两支的最早化石可追溯至3.13亿年前的石炭纪末。[210][211]合弓纲盘龙目及其后代兽孔目是最常见的二叠纪陆地脊椎动物。但当时这些化石都集中在中纬度温带地区，有证据表明靠近赤道的更热、更干燥的环境中，生活的主要是两栖动物和蜥形纲。[212]

二叠纪－三叠纪灭绝事件几乎消灭了所有陆地脊椎动物，[213]也消灭了绝大部分其他生物。[214]在后续缓慢的恢复过程中（约3000万年），[215]以前默默无闻的蜥形纲一跃成为最丰富、最多样的陆生脊椎动物：晚二叠世岩层中发现了少量主龙形类化石，[216]但到中三叠世，主龙类就已经成为了最主要的陆生脊椎动物。到晚三叠世恐龙脱颖而出，成为侏罗纪至白垩纪最重要的陆地脊椎动物。[217]

一些小型掠食兽脚亚目恐龙在晚侏罗世演化为鸟类。[218]:210–231第一批鸟类从恐龙那里继承了牙齿和长骨质尾巴，[218]有些鸟类到侏罗纪末尾已经演化出角质、无齿的鸟喙[219]，到早白垩世演化出尾综骨。[220]

古蜥类和恐龙在三叠纪蒸蒸日上时，合弓纲的后代哺乳形类演化为小型夜间食虫动物。这种生态位可能促进的哺乳动物的演化，例如夜间生活可能加速了恒温和体毛的发展。[221]到1.95亿年前的早侏罗世，有些动物已经非常像今日的哺乳动物了。[222]不幸的是，整个中侏罗世的化石记录都接近空白。[223]马达加斯加发现的牙齿化石表明，到1.67亿年前时，单孔目已经与其他哺乳动物发生了分化。[224]非鸟恐龙在支配陆地大约1.5亿年后，在白垩纪﹣古近纪灭绝事件（6600万年前）中与其他许多生物群一同灭亡。[225]哺乳动物整个恐龙时代都被限制在狭小的分类单元内，体型和种群大小也维持在很低的水平，但在大灭绝后，其大小和多样性飞速增加，[226][227]蝙蝠在1300万年内飞上天空，[228]鲸豚类在1500万年内重回大海。[229]

开花植物

主条目：被子植物
裸子植物
 
 
 
 

买麻藤属
（裸子）

 
 

百岁兰
（裸子）

 
 
 

麻黄属
（裸子）

 
 
 

本内苏铁目

 
 

被子植物

 
 
 
被子植物可能演化树之一[230]
裸子植物
 

被子植物

 
 
 
 
 

苏铁门
（裸子）

 
 

本内苏铁目

 
 
 

银杏属

 
 
 
 

买麻藤目
（裸子）

 
 

松柏门
（裸子）

 
 
 
 
另一种可能演化树[231]

第一朵花大约开在1.3亿年前。[232]被子植物共有约25－40万种，数量远超其他所有地面植物之和，是大多数陆地生态系统的主要植被。有化石证据表明，被子植物在早白垩世多样化，[230][231]与传粉昆虫的兴起密切相关。[231]在现代被子植物中，玉兰属被认为接近此类植物的共同祖先。[230]但古生物学家还没能成功识别出开花植物进化的最早阶段。[230][231]

社会性昆虫

主条目：真社会性
 
这些白蚁丘在森林火灾中幸存下来。

社会性昆虫之所以引人注目，是因为每个群落的绝大多数个体都不育。这似乎与自然选择、自私基因等进化的基本概念相悖。事实上，很少有真社会性的昆虫物种：在大约2600个现存昆虫科中，仅有15个科含有部分的社会性，而且节肢动物中真社会性似乎只独立进化了12次，尽管有些真社会性已经多样化到几个科。但社会性昆虫的成功是十分惊人的：尽管蚂蚁和白蚁只占已知昆虫物种的约2%，但它们构成了昆虫质量的50%以上。它们掌控自己领地的能力似乎是它们成功的基础。[233]

大多数个体为何牺牲繁殖机会，长期以来一直被解释为这些物种罕见的染色体倍性性别决定系统的影响。同一个蚁后的两个不育的工蚁彼此分享的基因要比它们理论上的后代还要多。[234]但艾德华·威尔森和伯特·霍尔多布勒认为，这种解释是错误的：它基于亲属选择，但没有证据表明在有多个蚁后的群落中存在裙带关系。相反，他们认为只有受捕食者和竞争者强大压力的物种，处于可以建造“堡垒”的环境中才会演化出真社会性。在蚁群初步建立这种安全之后，它们可以通过合作觅食获得其他优势。他们发现滨鼠科也演化出了真社会性，[233]而且它们不是单倍体。[235]

最早的昆虫化石发现于约4亿年前的早泥盆世岩层，只有少数不会飞的昆虫。约3亿年前晚石炭世的马孙溪化石层（英语：Mazon Creek fossil beds）中有约200种昆虫，其中一些以现代标准来看十分巨大，且表明当时昆虫已占据了植食性动物、食碎屑动物和食虫动物等代表性生态位。社会性白蚁和蚂蚁首次出现在早白垩世，先进的社会性蜜蜂出现在晚白垩世，但到新生代中期才变得丰富起来。[236]

人类

主条目：人类演化

现代人和其它生命都由一个古老的、共同的祖先进化而来，这一观点是罗伯特·钱伯斯于1844年提出来的，后来查尔斯·达尔文在1871年采纳。[237]现代人是从一种直立猿类进化而来，可追溯到600万年前的乍得沙赫人。[238]惊奇南方古猿大约于250万年前开凿了已知最早的石器，动物骨骼上发现了石器的划痕。[239]最早的人亚科物种脑容量近似黑猩猩，但在过去300万年中增加了4倍；一项统计分析表明，人科大脑大小几乎完全取决于化石年代，所属的物种之间相差很小。[240]现代人类是自各地同时进化出来还是非洲一个小种群的后代并在不到20万年时间里迁移到世界各地并取代以前的人种，存在着长期的争议。[241]:87–89解剖学意义上的现代人类在10万年前是否有智力、文化和技术上的“大跃进”也有争议，这可能是从化石中看不到的神经系统变化造成的。[242]

大灭绝事件

主条目：生物集群灭绝
单位：百万年
本图仅呈现地质年代各期的海洋生物灭绝比例，包含规模最大的五次灭绝事件。蓝色部份代表大致的灭绝属比例，以该时期与下一时期的化石纪录比较计算。

至少从5.42亿年前开始，地球上的生命就偶尔遭受大规模灭绝。虽然在当时是灾难，但大规模灭绝有时也加速了生命的演化。特定生态位的主导地位能在生物群落间转移，通常是灭绝事件消灭了旧主导群落，很少是因为新主导群落能在自然选择中胜过旧群落。[38][243]

所有属
“定义明确”的属
趋势线
五次大灭绝
其他大灭绝
百万年前
千个属
化石记录现实的泛生代生物多样性

化石记录似乎现实，大规模灭绝之间的间隔越来越长，平均灭绝率和背景灭绝率都在下降。这两种现象都可以用某种方式来解释：[244]

  • 过去5亿年中，海洋变得对生命更友好，更不易发生大规模灭绝：溶解氧变多，并渗透到更深的地方；陆上生命的发展减少了养分的流失，从而减少了富营养化和缺氧事件的风险；海洋生态系统变得更加多样化，食物链越来越难被打破。[245][246]
  • 完整的化石非常少见，绝大多数已灭绝生物都只有身体一部分的化石，且年代越早完整化石越罕见。因此古生物学家错误地将同一生物的不同部分归为不同物种，这些分类往往只是为了解释这种错误的发现而建立的—比如奇虾的故事。年代越古老，发生这种错误的可能性越大，因为这些化石往往既不像任何生物体的一部分，又常常保存得很差。许多“多余”的属仅包含一两块不再被发现的碎片，显得像这“多余”的属很快就灭绝了似的。[244]

化石记录中的生物多样性，即“……在任何特定时间还存在的单独属的数量；即那些首次出现在该时刻之前和最后出现在该时刻之后的属”[247]显示出不同的趋势：从542到400 Ma相当快速地上升；400到200Ma略有下降，其中毁灭性的二叠纪-三叠纪大灭绝事件是重要因素；200Ma至今迅速上升。[247]

另见

注释

  1. ^ 黏体动物曾被认为是一个例外，但现在被认为是发生过深刻改造的刺胞动物。 Jímenez-Guri, Eva; Philippe, Hervé; Okamura, Beth; et al. Buddenbrockia Is a Cnidarian Worm. Science. 2007-07-06, 317 (5834): 116–118. Bibcode:2007Sci...317..116J. ISSN 0036-8075. PMID 17615357. S2CID 5170702. doi:10.1126/science.1142024. 

脚注

  1. ^ 1.0 1.1 Pearce, Ben K.D.; Tupper, Andrew S.; Pudritz, Ralph E.; et al. Constraining the Time Interval for the Origin of Life on Earth. Astrobiology. 2018-03-01, 18 (3): 343–364. Bibcode:2018AsBio..18..343P. ISSN 1531-1074. PMID 29570409. S2CID 4419671. arXiv:1808.09460  . doi:10.1089/ast.2017.1674. 
  2. ^ 2.0 2.1 Rosing, Minik T. 13C-Depleted Carbon Microparticles in >3700-Ma Sea-Floor Sedimentary Rocks from West Greenland. Science. 1999-01-29, 283 (5402): 674–676. Bibcode:1999Sci...283..674R. ISSN 0036-8075. PMID 9924024. doi:10.1126/science.283.5402.674 （英语）. 
  3. ^ 3.0 3.1 Ohtomo, Yoko; Kakegawa, Takeshi; Ishida, Akizumi; et al. Evidence for biogenic graphite in early Archaean Isua metasedimentary rocks. Nature Geoscience. 2014-01, 7 (1): 25–28. Bibcode:2014NatGe...7...25O. ISSN 1752-0894. doi:10.1038/ngeo2025. 
  4. ^ Papineau, Dominic; De Gregorio, Bradley T.; Cody, George D.; et al. Young poorly crystalline graphite in the >3.8-Gyr-old Nuvvuagittuq banded iron formation. Nature Geoscience. 2011-06, 4 (6): 376–379. Bibcode:2011NatGe...4..376P. ISSN 1752-0894. doi:10.1038/ngeo1155. 
  5. ^ 5.0 5.1 Bell, Elizabeth A.; Boehnke, Patrick; Harrison, T. Mark; et al. Potentially biogenic carbon preserved in a 4.1 billion-year-old zircon (PDF). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2015-11-24, 112 (47): 14518–14521 [2020-02-14]. Bibcode:2015PNAS..11214518B. ISSN 0027-8424. PMC 4664351  . PMID 26483481. doi:10.1073/pnas.1517557112  . （原始内容存档 (PDF)于2020-02-13）. 
  6. ^ Nemchin, Alexander A.; Whitehouse, Martin J.; Menneken, Martina; et al. A light carbon reservoir recorded in zircon-hosted diamond from the Jack Hills. Nature. 2008-07-03, 454 (7200): 92–95. Bibcode:2008Natur.454...92N. ISSN 0028-0836. PMID 18596808. S2CID 4415308. doi:10.1038/nature07102. 
  7. ^ Futuyma 2005
  8. ^ Dybas, Cheryl; Fryling, Kevin. Researchers find that Earth may be home to 1 trillion species (新闻稿). Alexandria, VA: National Science Foundation. 2016-05-02 [2016-12-11]. News Release 16-052. （原始内容存档于2016-05-04）. 
  9. ^ Chapman 2009.
  10. ^ Novacek, Michael J. Prehistory's Brilliant Future. Sunday Review. New York Times (New York). 2014-11-08 [2014-12-25]. ISSN 0362-4331. （原始内容存档于2014-11-10）. 
  11. ^ Catalogue of Life: 2019 Annual Checklist. Species 2000; Integrated Taxonomic Information System. 2019 [2020-02-16]. （原始内容存档于2020-10-07）. 
  12. ^ McKinney 1997，第110页.
  13. ^ Stearns & Stearns 1999，第x页.
  14. ^ Nutman, Allen P.; Bennett, Vickie C.; Friend, Clark R.L.; et al. Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures (PDF). Nature. 2016-09-22, 537 (7621): 535–538 [2020-02-17]. Bibcode:2016Natur.537..535N. ISSN 0028-0836. PMID 27580034. S2CID 205250494. doi:10.1038/nature19355. （原始内容存档于2020-01-02）. 
  15. ^ Borenstein, Seth. Hints of life on what was thought to be desolate early Earth. Associated Press. 2015-10-19 [2020-02-17]. （原始内容存档于2018-07-12）. 
  16. ^ 16.0 16.1 Dodd, Matthew S.; Papineau, Dominic; Grenne, Tor; et al. Evidence for early life in Earth's oldest hydrothermal vent precipitates (PDF). Nature. 2017-03-02, 543 (7643): 60–64 [2020-02-18]. Bibcode:2017Natur.543...60D. ISSN 0028-0836. PMID 28252057. S2CID 2420384. doi:10.1038/nature21377  . （原始内容存档 (PDF)于2020-02-13）. 
  17. ^ Zimmer, Carl. Scientists Say Canadian Bacteria Fossils May Be Earth's Oldest. Matter. New York Times (New York). 2017-03-01 [2017-03-02]. ISSN 0362-4331. （原始内容存档于2020-01-04）. 
  18. ^ 18.0 18.1 18.2 Nisbet, Euan G.; Fowler, C.M.R. Archaean metabolic evolution of microbial mats. Proceedings of the Royal Society B. 1999-12-07, 266 (1436): 2375–2382. ISSN 0962-8452. PMC 1690475  . doi:10.1098/rspb.1999.0934. 
  19. ^ Beraldi-Campesi, Hugo. Early life on land and the first terrestrial ecosystems. Ecological Processes. 2013-02-23, 2 (1): 1–17. ISSN 2192-1709. doi:10.1186/2192-1709-2-1  . 
  20. ^ DasSarma, Shiladitya; Schwieterman, Edward W. Early evolution of purple retinal pigments on Earth and implications for exoplanet biosignatures. International Journal of Astrobiology (Cambridge University Press). 2018-10-11, 20 (3): 241–250 [2024-07-24]. doi:10.1017/S1473550418000423. （原始内容存档于2019-04-19）. 
  21. ^ Anbar, Ariel D.; Yun, Duan; Lyons, Timothy W.; et al. A Whiff of Oxygen Before the Great Oxidation Event?. Science. 2007-09-28, 317 (5846): 1903–1906. Bibcode:2007Sci...317.1903A. ISSN 0036-8075. PMID 17901330. S2CID 25260892. doi:10.1126/science.1140325. 
  22. ^ Knoll, Andrew H.; Javaux, Emmanuelle J.; Hewitt, David; et al. Eukaryotic organisms in Proterozoic oceans. Philosophical Transactions of the Royal Society B. 2006-06-29, 361 (1470): 1023–1038. ISSN 0962-8436. PMC 1578724  . PMID 16754612. doi:10.1098/rstb.2006.1843. 
  23. ^ 23.0 23.1 23.2 23.3 23.4 23.5 Fedonkin, Mikhail A. The origin of the Metazoa in the light of the Proterozoic fossil record (PDF). Paleontological Research. 2003-03-31, 7 (1): 9–41 [2008-09-02]. ISSN 1342-8144. S2CID 55178329. doi:10.2517/prpsj.7.9. （原始内容 (PDF)存档于2009-02-26）. 
  24. ^ 24.0 24.1 24.2 Bonner, John Tyler. The origins of multicellularity. Integrative Biology. 1998-01-07, 1 (1): 27–36. ISSN 1757-9694. doi:10.1002/(SICI)1520-6602(1998)1:1<27::AID-INBI4>3.0.CO;2-6. 
  25. ^ Strother, Paul K.; Battison, Leila; Brasier, Martin D.; et al. Earth's earliest non-marine eukaryotes. Nature. 2011-05-26, 473 (7348): 505–509. Bibcode:2011Natur.473..505S. ISSN 0028-0836. PMID 21490597. S2CID 4418860. doi:10.1038/nature09943. 
  26. ^ Jun-Yuan, Chen; Oliveri, Paola; Chia-Wei, Li; et al. Precambrian animal diversity: Putative phosphatized embryos from the Doushantuo Formation of China. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000-04-25, 97 (9): 4457–4462. Bibcode:2000PNAS...97.4457C. ISSN 0027-8424. PMC 18256  . PMID 10781044. doi:10.1073/pnas.97.9.4457  . 
  27. ^ Fedonkin, Mikhail A.; Simonetta, Alberto; Ivantsov, Andrei Yu. New data on Kimberella, the Vendian mollusc-like organism (White Sea region, Russia): palaeoecological and evolutionary implications (PDF). Geological Society Special Publications. 2007-01-01, 286 (1): 157–179 [2020-02-18]. Bibcode:2007GSLSP.286..157F. ISSN 0375-6440. S2CID 331187. doi:10.1144/SP286.12. （原始内容存档 (PDF)于2017-08-11）. 
  28. ^ Otto, Sarah P.; Lenormand, Thomas. Resolving the paradox of sex and recombination. Nature Reviews Genetics. 2002-04-01, 3 (4): 252–261. ISSN 1471-0056. PMID 11967550. S2CID 13502795. doi:10.1038/nrg761. 
  29. ^ Letunic, Ivica; Bork, Peer. iTOL: Interactive Tree of Life. Heidelberg, Germany: European Molecular Biology Laboratory. [2015-07-21]. （原始内容存档于2022-06-10）. 
  30. ^ 30.0 30.1 D-G., Shu; H-L., Luo; Conway Morris, Simon; et al. Lower Cambrian vertebrates from south China (PDF). Nature. 1999-11-04, 402 (6757): 42–46 [2015-01-22]. Bibcode:1999Natur.402...42S. ISSN 0028-0836. S2CID 4402854. doi:10.1038/46965. （原始内容 (PDF)存档于2009-02-26）. 
  31. ^ 31.0 31.1 31.2 Algeo, Thomas J.; Scheckler, Stephen E. Terrestrial-marine teleconnections in the Devonian: links between the evolution of land plants, weathering processes, and marine anoxic events. Philosophical Transactions of the Royal Society B. 1998-01-29, 353 (1365): 113–130. ISSN 0962-8436. PMC 1692181  . doi:10.1098/rstb.1998.0195. 
  32. ^ Hoyt, Donald F. Synapsid Reptiles. ZOO 138 Vertebrate Zoology (Lecture). Pomona, CA: California State Polytechnic University, Pomona. 1997-02-17 [2015-01-22]. （原始内容存档于2009-05-20）. 
  33. ^ Barry, Patrick L. Phillips, Tony , 编. The Great Dying. Science@NASA. 马歇尔太空飞行中心. 2002-01-28 [2015-01-22]. （原始内容存档于2010-04-10）. 
  34. ^ Tanner, Lawrence H.; Lucas, Spencer G.; Chapman, Mary G. Assessing the record and causes of Late Triassic extinctions (PDF). Earth-Science Reviews. 2004-03, 65 (1–2): 103–139 [2007-10-22]. Bibcode:2004ESRv...65..103T. doi:10.1016/S0012-8252(03)00082-5. （原始内容 (PDF)存档于2007-10-25）. 
  35. ^ Benton 1997
  36. ^ Fastovsky, David E.; Sheehan, Peter M. The Extinction of the Dinosaurs in North America (PDF). Geological Society of America. 2005-03, 15 (3): 4–10 [2015-01-23]. ISSN 1052-5173. doi:10.1130/1052-5173(2005)015<4:TEOTDI>2.0.CO;2. （原始内容存档 (PDF)于2019-03-22）. 
  37. ^ Roach, John. Dinosaur Extinction Spurred Rise of Modern Mammals. National Geographic News (Washington, D.C.: National Geographic Society). 2007-06-20 [2020-02-21]. （原始内容存档于2008-05-11）. 
  38. ^ 38.0 38.1 Van Valkenburgh, Blaire. Major Patterns in the History of Carnivorous Mammals. Annual Review of Earth and Planetary Sciences. 1999-05-01, 27: 463–493 [2022-05-04]. Bibcode:1999AREPS..27..463V. ISSN 1545-4495. doi:10.1146/annurev.earth.27.1.463. （原始内容存档于2020-02-29）. 
  39. ^ Erwin, Douglas H. Early metazoan life: divergence, environment and ecology. Philosophical Transactions of the Royal Society B. 2015-12-19, 370 (1684). ISSN 0962-8436. PMC 4650120  . PMID 26554036. doi:10.1098/rstb.2015.0036. Article 20150036. 
  40. ^ 40.0 40.1 El Albani, Abderrazak; Bengtson, Stefan; Canfield, Donald E.; et al. Large colonial organisms with coordinated growth in oxygenated environments 2.1 Gyr ago. Nature. 2010-07-01, 466 (7302): 100–104. Bibcode:2010Natur.466..100A. ISSN 0028-0836. PMID 20596019. S2CID 4331375. doi:10.1038/nature09166. 
  41. ^ 41.0 41.1 Dalrymple 1991
  42. ^ Galimov, Erik M.; Krivtsov, Anton M. Origin of the Earth—Moon system. Journal of Earth System Science. 2005-12, 114 (6): 593–600 [2020-02-22]. Bibcode:2005JESS..114..593G. CiteSeerX 10.1.1.502.314  . ISSN 0253-4126. S2CID 56094186. doi:10.1007/BF02715942. （原始内容存档于2021-08-13）. 
  43. ^ Thompson, Andrea. Oldest Rocks on Earth Found. Live Science (Watsonville, CA: Imaginova). 2008-09-25 [2015-01-23]. （原始内容存档于2022-05-13）. 
  44. ^ 44.0 44.1 Cohen, Barbara A.; Swindle, Timothy D.; Kring, David A. Support for the Lunar Cataclysm Hypothesis from Lunar Meteorite Impact Melt Ages. Science. 2000-12-01, 290 (5497): 1754–1756. Bibcode:2000Sci...290.1754C. ISSN 0036-8075. PMID 11099411. doi:10.1126/science.290.5497.1754. 
  45. ^ Early Earth Likely Had Continents And Was Habitable (新闻稿). Boulder, CO: University of Colorado. 2005-12-17 [2015-01-23]. （原始内容存档于2015-01-24）. 
  46. ^ Cavosie, Aaron J.; Valley, John W.; Wilde, Simon A.; Edinburgh Ion Microprobe Facility. Magmatic δ18O in 4400–3900 Ma detrital zircons: A record of the alteration and recycling of crust in the Early Archean. Earth and Planetary Science Letters. 2005-07-15, 235 (3–4): 663–681. Bibcode:2005E&PSL.235..663C. ISSN 0012-821X. doi:10.1016/j.epsl.2005.04.028. 
  47. ^ 47.0 47.1 47.2 Garwood, Russell J. Patterns In Palaeontology: The first 3 billion years of evolution. Palaeontology Online. 2012, 2 (Article 11): 1–14 [2020-02-25]. （原始内容存档于2012-12-09）. 
  48. ^ Britt, Robert Roy. Evidence for Ancient Bombardment of Earth. Space.com (Watsonville, CA: Imaginova). 2002-07-24 [2015-01-23]. （原始内容存档于2006-04-15）. 
  49. ^ Valley, John W.; Peck, William H.; King, Elizabeth M.; et al. A cool early Earth (PDF). Geology. 2002-04-01, 30 (4): 351–354 [2008-09-13]. Bibcode:2002Geo....30..351V. ISSN 0091-7613. PMID 16196254. doi:10.1130/0091-7613(2002)030<0351:ACEE>2.0.CO;2. （原始内容 (PDF)存档于2008-12-16）. 
  50. ^ Dauphas, Nicolas; Robert, François; Marty, Bernard. The Late Asteroidal and Cometary Bombardment of Earth as Recorded in Water Deuterium to Protium Ratio. Icarus. 2000-12, 148 (2): 508–512. Bibcode:2000Icar..148..508D. ISSN 0019-1035. doi:10.1006/icar.2000.6489. 
  51. ^ Scalice, Daniella. Fletcher, Julie , 编. Microbial Habitability During the Late Heavy Bombardment. Astrobiology. Mountain View, CA: NASA Astrobiology Program. 2009-05-20 [2020-02-25]. （原始内容存档于2015-01-24）. 
  52. ^ 52.0 52.1 Brasier, Martin; McLoughlin, Nicola; Green, Owen; et al. A fresh look at the fossil evidence for early Archaean cellular life (PDF). Philosophical Transactions of the Royal Society B. 2006-06, 361 (1470): 887–902 [2008-08-30]. ISSN 0962-8436. PMC 1578727  . PMID 16754605. doi:10.1098/rstb.2006.1835. （原始内容存档 (PDF)于2007-07-30）. 
  53. ^ Schopf, J. William. Microfossils of the Early Archean Apex Chert: New Evidence of the Antiquity of Life. Science. 1993-04-30, 260 (5108): 640–646. Bibcode:1993Sci...260..640S. ISSN 0036-8075. PMID 11539831. S2CID 2109914. doi:10.1126/science.260.5108.640. 
  54. ^ Mojzsis, Stephen J.; Arrhenius, Gustaf; McKeegan, Kevin D.; et al. Evidence for life on Earth before 3,800 million years ago. Nature. 1996-11-07, 384 (6604): 55–59. Bibcode:1996Natur.384...55M. ISSN 0028-0836. PMID 8900275. S2CID 4342620. doi:10.1038/384055a0. hdl:2060/19980037618  . 
  55. ^ 55.0 55.1 Grotzinger, John P.; Rothman, Daniel H. An abiotic model for stromatolite morphogenesis. Nature. 1996-10-03, 383 (6599): 423–425. Bibcode:1996Natur.383..423G. ISSN 0028-0836. S2CID 4325802. doi:10.1038/383423a0. 
  56. ^ Fedo, Christopher M.; Whitehouse, Martin J. Metasomatic Origin of Quartz-Pyroxene Rock, Akilia, Greenland, and Implications for Earth's Earliest Life. Science. 2002-05-24, 296 (5572): 1448–1452. Bibcode:2002Sci...296.1448F. ISSN 0036-8075. PMID 12029129. S2CID 10367088. doi:10.1126/science.1070336. 
  57. ^ Schopf, J. William. Fossil evidence of Archaean life. Philosophical Transactions of the Royal Society B. 2006-06-29, 361 (1470): 869–885. ISSN 0962-8436. PMC 1578735  . PMID 16754604. doi:10.1098/rstb.2006.1834. 
  58. ^ Drake, Nadia. This May Be the Oldest Known Sign of Life on Earth. National Geographic News (Washington, D.C.: National Geographic Society). 2017-03-01 [2020-02-26]. （原始内容存档于2019-10-23）. 
  59. ^ Mason, Stephen F. Origins of biomolecular handedness. Nature. 1984-09-06, 311 (5981): 19–23. Bibcode:1984Natur.311...19M. ISSN 0028-0836. PMID 6472461. S2CID 103653. doi:10.1038/311019a0. 
  60. ^ Orgel, Leslie E. The Origin of Life on the Earth (PDF). Scientific American. Vol. 271 no. 4. 1994-10: 76–83 [2008-08-30]. Bibcode:1994SciAm.271d..76O. ISSN 0036-8733. PMID 7524147. doi:10.1038/scientificamerican1094-76. （原始内容存档于2001-01-24）. 
  61. ^ Bennett 2008，第82–85页
  62. ^ Schulze-Makuch, Dirk; Irwin, Louis N. The prospect of alien life in exotic forms on other worlds. Naturwissenschaften. 2006-04, 93 (4): 155–172. Bibcode:2006NW.....93..155S. ISSN 0028-1042. PMID 16525788. S2CID 3207913. doi:10.1007/s00114-005-0078-6. 
  63. ^ Peretó, Juli. Controversies on the origin of life (PDF). International Microbiology. 2005-03, 8 (1): 23–31 [2007-10-07]. ISSN 1139-6709. PMID 15906258. （原始内容 (PDF)存档于2007-06-04）. 
  64. ^ Szathmáry, Eörs. In search of the simplest cell. Nature. 2005-02-03, 433 (7025): 469–470. Bibcode:2005Natur.433..469S. ISSN 0028-0836. PMID 15690023. S2CID 4360797. doi:10.1038/433469a. 
  65. ^ Luisi, Pier Luigi Luisi; Ferri, Francesca; Stano, Pasquale. Approaches to semi-synthetic minimal cells: a review. Naturwissenschaften. 2006-01, 93 (1): 1–13. Bibcode:2006NW.....93....1L. ISSN 0028-1042. PMID 16292523. S2CID 16567006. doi:10.1007/s00114-005-0056-z. 
  66. ^ Joyce, Gerald F. The antiquity of RNA-based evolution. Nature. 2002-07-11, 418 (6894): 214–221. Bibcode:2002Natur.418..214J. ISSN 0028-0836. PMID 12110897. S2CID 4331004. doi:10.1038/418214a. 
  67. ^ 67.0 67.1 Hoenigsberg, Hugo. Evolution without speciation but with selection: LUCA, the Last Universal Common Ancestor in Gilbert's RNA world. Genetics and Molecular Research. 2003-12-30, 2 (4): 366–375 [2008-08-30]. ISSN 1676-5680. PMID 15011140. （原始内容存档于2004-06-02）. 
  68. ^ Trevors, Jack T.; Abel, David L. Chance and necessity do not explain the origin of life. Cell Biology International. 2004-11, 28 (11): 729–739. ISSN 1065-6995. PMID 15563395. S2CID 30633352. doi:10.1016/j.cellbi.2004.06.006. 
  69. ^ Forterre, Patrick; Benachenhou-Lahfa, Nadia; Confalonieri, Fabrice; et al. Adoutte, André; Perasso, Roland , 编. The nature of the last universal ancestor and the root of the tree of life, still open questions. BioSystems. 1992, 28 (1–3): 15–32. ISSN 0303-2647. PMID 1337989. doi:10.1016/0303-2647(92)90004-I.  Part of a special issue: 9th Meeting of the International Society for Evolutionary Protistology, July 3–7, 1992, Orsay, France.
  70. ^ Cech, Thomas R. The Ribosome Is a Ribozyme. Science. 2000-08-11, 289 (5481): 878–879. ISSN 0036-8075. PMID 10960319. S2CID 24172338. doi:10.1126/science.289.5481.878. 
  71. ^ Pearce, Ben K. D.; Pudritz, Ralph E.; Semenov, Dmitry A.; et al. Origin of the RNA world: The fate of nucleobases in warm little ponds. 国家科学院院刊. 2017-10-24, 114 (43): 11327–11332. Bibcode:2017PNAS..11411327P. ISSN 0027-8424. PMC 5664528  . PMID 28973920. arXiv:1710.00434  . doi:10.1073/pnas.1710339114  . 
  72. ^ Johnston, Wendy K.; Unrau, Peter J.; Lawrence, Michael S.; et al. RNA-Catalyzed RNA Polymerization: Accurate and General RNA-Templated Primer Extension (PDF). Science. 2001-05-18, 292 (5520): 1319–1325. Bibcode:2001Sci...292.1319J. CiteSeerX 10.1.1.70.5439  . ISSN 0036-8075. PMID 11358999. S2CID 14174984. doi:10.1126/science.1060786. （原始内容存档 (PDF)于2006-09-09）. 
  73. ^ 73.0 73.1 Levy, Matthew; Miller, Stanley L. The stability of the RNA bases: Implications for the origin of life. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998-07-07, 95 (14): 7933–7938. Bibcode:1998PNAS...95.7933L. ISSN 0027-8424. PMC 20907  . PMID 9653118. doi:10.1073/pnas.95.14.7933  . 
  74. ^ Orgel, Leslie E. A Simpler Nucleic Acid. Science. 2000-11-17, 290 (5495): 1306–1307. ISSN 0036-8075. PMID 11185405. S2CID 83662769. doi:10.1126/science.290.5495.1306. 
  75. ^ Nelson, Kevin E.; Levy, Matthew; Miller, Stanley L. Peptide nucleic acids rather than RNA may have been the first genetic molecule. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000-04-11, 97 (8): 3868–3871. Bibcode:2000PNAS...97.3868N. ISSN 0027-8424. PMC 18108  . PMID 10760258. doi:10.1073/pnas.97.8.3868  . 
  76. ^ Martin, William; Russell, Michael J. On the origins of cells: a hypothesis for the evolutionary transitions from abiotic geochemistry to chemoautotrophic prokaryotes, and from prokaryotes to nucleated cells. Philosophical Transactions of the Royal Society B. 2003-01-29, 358 (1429): 59–85. ISSN 0962-8436. PMC 1693102  . PMID 12594918. doi:10.1098/rstb.2002.1183. 
  77. ^ Wächtershäuser, Günter. Life as We Don't Know It. Science. 2000-08-25, 289 (5483): 1307–1308. ISSN 0036-8075. PMID 10979855. doi:10.1126/science.289.5483.1307. 
  78. ^ Trevors, Jack T.; Psenner, Roland. From self-assembly of life to present-day bacteria: a possible role for nanocells. FEMS Microbiology Reviews. 2001-12, 25 (5): 573–582. ISSN 0168-6445. PMID 11742692. doi:10.1111/j.1574-6976.2001.tb00592.x  . 
  79. ^ Segré, Daniel; Ben-Eli, Dafna; Deamer, David W.; et al. The Lipid World (PDF). Origins of Life and Evolution of Biospheres. 2001-02, 31 (1–2): 119–145 [2020-02-28]. Bibcode:2001OLEB...31..119S. ISSN 0169-6149. PMID 11296516. S2CID 10959497. doi:10.1023/A:1006746807104. （原始内容存档 (PDF)于2015-06-26）. 
  80. ^ Cairns-Smith 1968
  81. ^ Ferris, James P. Prebiotic Synthesis on Minerals: Bridging the Prebiotic and RNA Worlds. The Biological Bulletin. 1999-06, 196 (3): 311–314. ISSN 0006-3185. JSTOR 1542957. PMID 10390828. doi:10.2307/1542957.  "This paper was originally presented at a workshop titled Evolution: A Molecular Point of View."
  82. ^ Hanczyc, Martin M.; Fujikawa, Shelly M.; Szostak, Jack W. Experimental Models of Primitive Cellular Compartments: Encapsulation, Growth, and Division. Science. 2003-10-24, 302 (5645): 618–622. Bibcode:2003Sci...302..618H. ISSN 0036-8075. PMC 4484575  . PMID 14576428. doi:10.1126/science.1089904. 
  83. ^ Hartman, Hyman. Photosynthesis and the Origin of Life. Origins of Life and Evolution of Biospheres. 1998-10, 28 (4–6): 512–521. Bibcode:1998OLEB...28..515H. ISSN 0169-6149. PMID 11536891. S2CID 2464. doi:10.1023/A:1006548904157. 
  84. ^ O'Leary 2008
  85. ^ 85.0 85.1 Arrhenius 1980
  86. ^ Hoyle, Fred; Wickramasinghe, Nalin C. On the Nature of Interstellar Grains. Astrophysics and Space Science. 1979-11, 66 (1): 77–90. Bibcode:1979Ap&SS..66...77H. ISSN 0004-640X. S2CID 115165958. doi:10.1007/BF00648361. 
  87. ^ 87.0 87.1 Crick, Francis H.; Orgel, Leslie E. Directed Panspermia. Icarus. 1973-07, 19 (3): 341–346. Bibcode:1973Icar...19..341C. ISSN 0019-1035. doi:10.1016/0019-1035(73)90110-3. 
  88. ^ 88.0 88.1 88.2 Warmflash, David; Weiss, Benjamin. Did Life Come From Another World?. Scientific American. Vol. 293 no. 5. 2005-11: 64–71. Bibcode:2005SciAm.293e..64W. ISSN 0036-8733. PMID 16318028. doi:10.1038/scientificamerican1105-64. 
  89. ^ Wickramasinghe, Nalin C.; Wickramasinghe, Janaki T. On the possibility of microbiota transfer from Venus to Earth. Astrophysics and Space Science. 2008-09, 317 (1–2): 133–137. Bibcode:2008Ap&SS.317..133W. CiteSeerX 10.1.1.470.2347  . ISSN 0004-640X. S2CID 14623053. doi:10.1007/s10509-008-9851-2. 
  90. ^ Clancy, Brack & Horneck 2005
  91. ^ Horneck, Gerda; Klaus, David M.; Mancinelli, Rocco L. Space Microbiology. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 2010-03, 74 (1): 121–156. Bibcode:2010MMBR...74..121H. PMC 2832349  . PMID 20197502. doi:10.1128/mmbr.00016-09. 
  92. ^ Than, Ker. Claim of Martian Life Called 'Bogus'. Space.com (Watsonville, CA: Imaginova). 2007-08-23 [2015-01-25]. （原始内容存档于2011-05-08）. 
  93. ^ 93.0 93.1 Krumbein et al. 2003，第1–28页
  94. ^ 94.0 94.1 Risatti, J. Bruno; Capman, William C.; Stahl, David A. Community structure of a microbial mat: The phylogenetic dimension. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994-10-11, 91 (21): 10173–10177. Bibcode:1994PNAS...9110173R. ISSN 0027-8424. PMC 44980  . PMID 7937858. doi:10.1073/pnas.91.21.10173  . 
  95. ^ Biodiversity rocks. Nature (Editor's summary). 2006-06-08, 441 (7094) [2020-03-03]. ISSN 0028-0836. （原始内容存档于2006-06-19）. 
  96. ^ Allwood, Abigail C.; Walter, Malcolm R.; Kamber, Balz S.; et al. Stromatolite reef from the Early Archaean era of Australia. Nature. June 8, 2006, 441 (7094): 714–718. Bibcode:2006Natur.441..714A. ISSN 0028-0836. PMID 16760969. S2CID 4417746. doi:10.1038/nature04764. 
  97. ^ Blankenship, Robert E. Molecular evidence for the evolution of photosynthesis. Trends in Plant Science. 2001-01-01, 6 (1): 4–6. PMID 11164357. doi:10.1016/S1360-1385(00)01831-8. 
  98. ^ Hoehler, Tori M.; Bebout, Brad M.; Des Marais, David J. The role of microbial mats in the production of reduced gases on the early Earth. Nature. 2001-07-19, 412 (6844): 324–327. Bibcode:2001Natur.412..324H. ISSN 0028-0836. PMID 11460161. S2CID 4365775. doi:10.1038/35085554. 
  99. ^ 99.0 99.1 Schmidt-Rohr, K. (2020). "Oxygen Is the High-Energy Molecule Powering Complex Multicellular Life: Fundamental Corrections to Traditional Bioenergetics". ACS Omega 5: 2221-2233. http://dx.doi.org/10.1021/acsomega.9b03352 （页面存档备份，存于互联网档案馆）.
  100. ^ Abele, Doris. Toxic oxygen: The radical life-giver (PDF). Nature. 2002-11-07, 420 (6911): 27 [2020-03-03]. Bibcode:2002Natur.420...27A. ISSN 0028-0836. PMID 12422197. S2CID 4317378. doi:10.1038/420027a. （原始内容 (PDF)存档于2022-05-12）. 
  101. ^ Westerdahl, Becky B. Introduction to Aerobic Respiration. Biological Science 10V (Lecture). Davis, CA: University of California, Davis. 2007 [2008-07-14]. （原始内容存档于2007-10-29）. 
  102. ^ Goldblatt, Colin; Lenton, Timothy M.; Watson, Andrew J. The Great Oxidation at ~2.4 Ga as a bistability in atmospheric oxygen due to UV shielding by ozone (PDF). Geophysical Research Abstracts. 2006, 8 (770) [2020-03-05]. ISSN 1029-7006. SRef-ID: 1607-7962/gra/EGU06-A-00770. （原始内容存档 (PDF)于2007-09-26）. 
  103. ^ 103.0 103.1 Glansdorff, Nicolas; Ying, Xu; Labedan, Bernard. The Last Universal Common Ancestor: emergence, constitution and genetic legacy of an elusive forerunner. Biology Direct. 2008-07-09, 3 (29): 29. ISSN 1745-6150. PMC 2478661  . PMID 18613974. doi:10.1186/1745-6150-3-29. 
  104. ^ 104.0 104.1 Brocks, Jochen J.; Logan, Graham A.; Buick, Roger; et al. Archean Molecular Fossils and the Early Rise of Eukaryotes. Science. 1999-08-13, 285 (5430): 1033–1036. Bibcode:1999Sci...285.1033B. CiteSeerX 10.1.1.516.9123  . ISSN 0036-8075. PMID 10446042. doi:10.1126/science.285.5430.1033. 
  105. ^ 105.0 105.1 105.2 Hedges, S. Blair; Blair, Jaime E.; Venturi, Maria L.; et al. A molecular timescale of eukaryote evolution and the rise of complex multicellular life. BMC Evolutionary Biology. 2004-01-28, 4: 2. ISSN 1471-2148. PMC 341452  . PMID 15005799. doi:10.1186/1471-2148-4-2. 
  106. ^ Adl, Sina M.; Simpson, Alastair G.B.; Lane, Christopher E.; et al. The revised classification of eukaryotes (PDF). Journal of Eukaryotic Microbiology. 2012-09, 59 (5): 429–514 [2020-03-06]. ISSN 1066-5234. PMC 3483872  . PMID 23020233. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. （原始内容 (PDF)存档于2013-12-16）. 
  107. ^ Burki, Fabien. The Eukaryotic Tree of Life from a Global Phylogenomic Perspective. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 2014-05, 6 (5): a016147. ISSN 1943-0264. PMC 3996474  . PMID 24789819. doi:10.1101/cshperspect.a016147. 
  108. ^ Margulis 1981
  109. ^ Vellai, Tibor; Vida, Gábor. The origin of eukaryotes: the difference between prokaryotic and eukaryotic cells. Proceedings of the Royal Society B. 1999-08-07, 266 (1428): 1571–1577. ISSN 0962-8452. PMC 1690172  . PMID 10467746. doi:10.1098/rspb.1999.0817. 
  110. ^ Selosse, Marc-André; Abert, Béatrice; Godelle, Bernard. Reducing the genome size of organelles favours gene transfer to the nucleus. Trends in Ecology & Evolution. 2001-05-01, 16 (3): 135–141. ISSN 0169-5347. PMID 11179577. doi:10.1016/S0169-5347(00)02084-X. 
  111. ^ Pisani, Davide; Cotton, James A.; McInerney, James O. Supertrees Disentangle the Chimerical Origin of Eukaryotic Genomes. Molecular Biology and Evolution. 2007-08, 24 (8): 1752–1760. ISSN 0737-4038. PMID 17504772. doi:10.1093/molbev/msm095  . 
  112. ^ Gray, Michael W.; Burger, Gertraud; Lang, B. Franz. Mitochondrial Evolution. Science. 1999-05-05, 283 (5407): 1476–1481. Bibcode:1999Sci...283.1476G. ISSN 0036-8075. PMC 3428767  . PMID 10066161. doi:10.1126/science.283.5407.1476. 
  113. ^ Rasmussen, Birger; Fletcher, Ian R.; Brocks, Jochen J.; et al. Reassessing the first appearance of eukaryotes and cyanobacteria. Nature. 2008-10-23, 455 (7216): 1101–1104. Bibcode:2008Natur.455.1101R. ISSN 0028-0836. PMID 18948954. S2CID 4372071. doi:10.1038/nature07381. 
  114. ^ Tsu-Ming, Han; Runnegar, Bruce. Megascopic eukaryotic algae from the 2.1-billion-year-old negaunee iron-formation, Michigan. Science. 1992-07-10, 257 (5067): 232–235. Bibcode:1992Sci...257..232H. ISSN 0036-8075. PMID 1631544. doi:10.1126/science.1631544. 
  115. ^ Javaux, Emmanuelle J.; Knoll, Andrew H.; Walter, Malcolm R. TEM evidence for eukaryotic diversity in mid-Proterozoic oceans. Geobiology. 2004-07, 2 (3): 121–132. ISSN 1472-4677. doi:10.1111/j.1472-4677.2004.00027.x. 
  116. ^ 116.0 116.1 Butterfield, Nicholas J. Probable Proterozoic fungi. Paleobiology. 2005, 31 (1): 165–182 [2020-03-10]. ISSN 0094-8373. doi:10.1666/0094-8373(2005)031<0165:PPF>2.0.CO;2. （原始内容存档于2018-12-23）. 
  117. ^ Wise, Robert R. 1. The Diversity of Plastid Form and Function. Advances in Photosynthesis and Respiration 23. Springer. 2006: 3–26. ISBN 978-1-4020-4060-3. doi:10.1007/978-1-4020-4061-0_1. 
  118. ^ 118.0 118.1 118.2 118.3 118.4 Neiman, Maurine; Jokela, Jukka. Encyclopedia of Life Sciences. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons. 2010. ISBN 978-0-470-01617-6. doi:10.1002/9780470015902.a0001716.pub2. 
  119. ^ Holmes & Jobling 1996
  120. ^ Christie, Peter J. Type IV secretion: intercellular transfer of macromolecules by systems ancestrally related to conjugation machines. Molecular Microbiology. 2001-04, 40 (2): 294–305. ISSN 0950-382X. PMC 3922410  . PMID 11309113. doi:10.1046/j.1365-2958.2001.02302.x. 
  121. ^ Michod, Richard E.; Bernstein, Harris; Nedelcu, Aurora M. Adaptive value of sex in microbial pathogens (PDF). Infection, Genetics and Evolution. 2008-05, 8 (3): 267–285 [2022-05-05]. ISSN 1567-1348. PMID 18295550. doi:10.1016/j.meegid.2008.01.002. （原始内容 (PDF)存档于2020-05-11）. 
  122. ^ Bernstein, Harris; Bernstein, Carol. Evolutionary Origin of Recombination during Meiosis. BioScience. 2010-07, 60 (7): 498–505. ISSN 0006-3568. S2CID 86663600. doi:10.1525/bio.2010.60.7.5. 
  123. ^ Johnsborg, Ola; Eldholm, Vegard; Håvarstein, Leiv Sigve. Natural genetic transformation: prevalence, mechanisms and function. Research in Microbiology. 2007-12, 158 (10): 767–778. ISSN 0923-2508. PMID 17997281. doi:10.1016/j.resmic.2007.09.004. 
  124. ^ Bernstein, Bernstein & Michod 2012
  125. ^ Ramesh, Marilee A.; Malik, Shehre-Banoo; Logsdon, John M., Jr. A Phylogenomic Inventory of Meiotic Genes: Evidence for Sex in Giardia and an Early Eukaryotic Origin of Meiosis. Current Biology. 2005-01-26, 15 (2): 185–191. ISSN 0960-9822. PMID 15668177. S2CID 17013247. doi:10.1016/j.cub.2005.01.003  . 
  126. ^ 126.0 126.1 Otto, Sarah P.; Gerstein, Aleeza C. Why have sex? The population genetics of sex and recombination. Biochemical Society Transactions. 2006-08, 34 (4): 519–522. ISSN 0300-5127. PMID 16856849. doi:10.1042/BST0340519. 
  127. ^ 127.0 127.1 Lin Dong; Shuhai Xiao; Bing Shen; et al. Silicified Horodyskia and Palaeopascichnus from upper Ediacaran cherts in South China: tentative phylogenetic interpretation and implications for evolutionary stasis. Journal of the Geological Society. January 1, 2008, 165 (1): 367–378. Bibcode:2008JGSoc.165..367D. ISSN 0016-7649. S2CID 129309037. doi:10.1144/0016-76492007-074. 
  128. ^ Hanley, Kathryn A.; Fisher, Robert N.; Case, Ted J. Lower Mite Infestations in an Asexual Gecko Compared With Its Sexual Ancestors. Evolution. 1995-06, 49 (3): 418–426. ISSN 0014-3820. JSTOR 2410266. PMID 28565091. doi:10.2307/2410266. 
  129. ^ Parker, Matthew A. Pathogens and sex in plants. Evolutionary Ecology. 1994-09, 8 (5): 560–584. ISSN 0269-7653. S2CID 31756267. doi:10.1007/bf01238258. 
  130. ^ Bernstein, H., Byerly, H., Hopf, F. and Michod, R. Origin of sex. Journal of Theoretical Biology. 1984, 110 (3): 323–351. PMID 6209512. doi:10.1016/S0022-5193(84)80178-2. 
  131. ^ 131.0 131.1 Judson, O. Dr. Tatiana's sex advice to all creation . New York: Metropolitan Books. 2002: 233–4. ISBN 0-8050-6331-5. 
  132. ^ Hickey, D. Selfish DNA: A Sexually-Transmitted Nuclear Parasite. Genetics. 1982, 101 (3–4): 519–31. PMC 1201875  . PMID 6293914. 
  133. ^ DasSarma, S. Extreme Microbes. American Scientist. 2007, 95 (3): 224–231. doi:10.1511/2007.65.1024. 
  134. ^ Sterrer, W. On the origin of sex as vaccination. Journal of Theoretical Biology. 2002, 216 (4): 387–96. PMID 12151256. doi:10.1006/jtbi.2002.3008. 
  135. ^ Birdsell & Wills 2003
  136. ^ Bell, Graham; Mooers, Arne O. Size and complexity among multicellular organisms (PDF). Biological Journal of the Linnean Society. 1997-03, 60 (3): 345–363 [2015-02-02]. ISSN 0024-4066. doi:10.1111/j.1095-8312.1997.tb01500.x  . （原始内容 (PDF)存档于2016-03-05）. 
  137. ^ Kaiser, Dale. Building a Multicellular Organism. Paleontological Research. 2001-12, 35: 103–123. ISSN 0066-4197. PMID 11700279. doi:10.1146/annurev.genet.35.102401.090145. 
  138. ^ 138.0 138.1 Nakagaki, Toshiyuki; Yamada, Hiroyasu; Tóth, Ágota. Maze-solving by an amoeboid organism. Nature. 2000-09-28, 407 (6803): 470. Bibcode:2000Natur.407..470N. ISSN 0028-0836. PMID 11028990. S2CID 205009141. doi:10.1038/35035159  . 
  139. ^ Koschwanez, John H.; Foster, Kevin R.; Murray, Andrew W. Sucrose Utilization in Budding Yeast as a Model for the Origin of Undifferentiated Multicellularity. PLOS Biology. 2011-08-09, 9 (8): e1001122. ISSN 1544-9173. PMC 3153487  . PMID 21857801. doi:10.1371/journal.pbio.1001122. 
  140. ^ 140.0 140.1 140.2 140.3 140.4 Butterfield, Nicholas J. Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp.: implications for the evolution of sex, multicellularity, and the Mesoproterozoic/Neoproterozoic radiation of eukaryotes. Paleobiology. 2000, 26 (3): 386–404 [2015-02-01]. ISSN 0094-8373. doi:10.1666/0094-8373(2000)026<0386:BPNGNS>2.0.CO;2. （原始内容存档于2016-10-23）. 
  141. ^ Jinpu, Jin; Kun, He; Xing, Tang; et al. An Arabidopsis transcriptional regulatory map reveals distinct functional and evolutionary features of novel transcription factors. Molecular Biology and Evolution. 2015-07, 32 (7): 1767–1773. ISSN 0737-4038. PMC 4476157  . PMID 25750178. doi:10.1093/molbev/msv058. 
  142. ^ Dickey, Gwyneth. Evidence for earlier multicellular life. Science News. Vol. 178 no. 3. 2010-07-31: 17 [2015-02-02]. ISSN 0036-8423. doi:10.1002/scin.5591780322. （原始内容 (PNG)存档于2018-10-31）. 
  143. ^ Gaidos, Eric J.; Dubuc, Timothy; Dunford, Mike; et al. The Precambrian emergence of animal life: a geobiological perspective. Geobiology. 2007-12, 5 (4): 351–373. ISSN 1472-4677. doi:10.1111/j.1472-4669.2007.00125.x. 
  144. ^ Davidson, Michael W. Animal Cell Structure. Molecular Expressions. Tallahassee, FL: Florida State University. 2005-05-26 [2008-09-03]. （原始内容存档于2007-09-20）. 
  145. ^ Saupe, Stephen G. Concepts of Biology. Concepts of Biology (BIOL116) (Lecture). St. Joseph, MN: College of Saint Benedict and Saint John's University. 2004-01-03 [2008-09-03]. （原始内容存档于2007-11-21）. 
  146. ^ Hinde 2001
  147. ^ 147.0 147.1 Chen, Xiaozheng. Researchers say animal-like embryos preceded animal appearance (新闻稿). EurekAlert!. EurekAlert!. 2019-11-27 [2019-11-28]. （原始内容存档于2019-11-28）. 
  148. ^ 148.0 148.1 Zimmer, Carl. Is This the First Fossil of an Embryo? - Mysterious 609-million-year-old balls of cells may be the oldest animal embryos — or something else entirely.. Matter. New York Times (New York). 2019-11-27 [2019-11-28]. ISSN 0362-4331. （原始内容存档于2022-05-14）. 
  149. ^ Cunningham, John A.; Liu, Alexander G.; Bengtson, Stefan; et al. The origin of animals: Can molecular clocks and the fossil record be reconciled?. BioEssays. 2017-01, 39 (1): e201600120. ISSN 0265-9247. PMID 27918074. doi:10.1002/bies.201600120  . 
  150. ^ Jun-Yuan, Chen; Oliveri, Paola; Feng, Gao; et al. Precambrian Animal Life: Probable Developmental and Adult Cnidarian Forms from Southwest China (PDF). Developmental Biology. 2002-08-01, 248 (1): 182–196 [2015-02-04]. ISSN 0012-1606. PMID 12142030. doi:10.1006/dbio.2002.0714. （原始内容 (PDF)存档于2013-03-26）. 
  151. ^ Grazhdankin, Dima. Patterns of distribution in the Ediacaran biotas: facies versus biogeography and evolution. Paleobiology. 2004-06, 30 (2): 203–221. ISSN 0094-8373. doi:10.1666/0094-8373(2004)030<0203:PODITE>2.0.CO;2. 
  152. ^ Seilacher, Adolf. Vendobionta and Psammocorallia: lost constructions of Precambrian evolution. Journal of the Geological Society. 1992-08, 149 (4): 607–613 [2015-02-04]. Bibcode:1992JGSoc.149..607S. ISSN 0016-7649. S2CID 128681462. doi:10.1144/gsjgs.149.4.0607. （原始内容存档于2022-04-22）. 
  153. ^ Martin, Mark W.; Grazhdankin, Dmitriy V.; Bowring, Samuel A.; et al. Age of Neoproterozoic Bilaterian Body and Trace Fossils, White Sea, Russia: Implications for Metazoan Evolution. Science. 2000-05-05, 288 (5467): 841–845. Bibcode:2000Sci...288..841M. ISSN 0036-8075. PMID 10797002. doi:10.1126/science.288.5467.841. 
  154. ^ Fedonkin, Mikhail A.; Waggoner, Benjamin M. The late Precambrian fossil Kimberella is a mollusc-like bilaterian organism. Nature. 1997-08-28, 388 (6645): 868–871. Bibcode:1997Natur.388..868F. ISSN 0028-0836. S2CID 4395089. doi:10.1038/42242. 
  155. ^ Mooi, Rich; David, Bruno. Evolution Within a Bizarre Phylum: Homologies of the First Echinoderms. Integrative and Comparative Biology. 1998-12, 38 (6): 965–974. ISSN 0003-1569. doi:10.1093/icb/38.6.965  . 
  156. ^ McMenamin, Mark A. S. Spriggina is a trilobitoid ecdysozoan. Geoscience Horizons Seattle 2003. Abstracts with Programs 35 (6). Boulder, CO: Geological Society of America: 105. 2003-09 [2007-11-24]. ISSN 0016-7592. OCLC 249088612. （原始内容存档于2016-04-12）.  40-2号论文于2003年11月2日发表于美国地质学会2003年西雅图年会（2003年11月2–5日），于华盛顿州会议中心。
  157. ^ Jih-Pai, Lin; Gon, Samuel M., III; Gehling, James G.; et al. A Parvancorina-like arthropod from the Cambrian of South China. Historical Biology. 2006, 18 (1): 33–45. ISSN 0891-2963. S2CID 85821717. doi:10.1080/08912960500508689. 
  158. ^ Butterfield, Nicholas J. Hooking some stem-group 'worms': fossil lophotrochozoans in the Burgess Shale. BioEssays. 2006-12, 28 (12): 1161–1166. ISSN 0265-9247. PMID 17120226. S2CID 29130876. doi:10.1002/bies.20507. 
  159. ^ 159.0 159.1 159.2 Bengtson 2004
  160. ^ 160.0 160.1 Gould 1989
  161. ^ Budd, Graham E. The Cambrian Fossil Record and the Origin of the Phyla. Integrative and Comparative Biology. 2003-02, 43 (1): 157–165. ISSN 1540-7063. PMID 21680420. doi:10.1093/icb/43.1.157  . 
  162. ^ Budd, Graham E. The morphology of Opabinia regalis and the reconstruction of the arthropod stem-group. Lethaia. 1996-05, 29 (1): 1–14. ISSN 0024-1164. doi:10.1111/j.1502-3931.1996.tb01831.x. 
  163. ^ Marshall, Charles R. Explaining the Cambrian 'Explosion' of Animals. Annual Review of Earth and Planetary Sciences. 2006-05-30, 34: 355–384. Bibcode:2006AREPS..34..355M. ISSN 1545-4495. S2CID 85623607. doi:10.1146/annurev.earth.33.031504.103001. 
  164. ^ Janvier, Philippe. Encyclopedia of Life Sciences. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons. 2001. ISBN 978-0-470-01617-6. doi:10.1038/npg.els.0001531. 
  165. ^ Conway Morris, Simon. Once we were worms. 新科学人. Vol. 179 no. 2406. 2003-08-02: 34 [2008-09-05]. ISSN 0262-4079. （原始内容存档于2008-07-25）. 
  166. ^ Jun-Yuan Chen; Di-Ying Huang; Qing-Qing Peng; et al. The first tunicate from the Early Cambrian of South China. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003-07-08, 100 (14): 8314–8318. Bibcode:2003PNAS..100.8314C. ISSN 0027-8424. PMC 166226  . PMID 12835415. doi:10.1073/pnas.1431177100  . 
  167. ^ D.-G. Shu; Conway Morris, Simon; J. Han; et al. Head and backbone of the Early Cambrian vertebrate Haikouichthys. Nature. 2003-01-30, 421 (6922): 526–529. Bibcode:2003Natur.421..526S. ISSN 0028-0836. PMID 12556891. S2CID 4401274. doi:10.1038/nature01264. 
  168. ^ Sansom, Smith & Smith 2001
  169. ^ Zhu, You-an; Li, Qiang; Lu, Jing; Chen, Yang; Wang, Jianhua; Gai, Zhikun; Zhao, Wenjin; Wei, Guangbiao; Yu, Yilun; Ahlberg, Per E.; Zhu, Min. The oldest complete jawed vertebrates from the early Silurian of China. Nature. 2022-09, 609 (7929) [2022-10-21]. ISSN 1476-4687. doi:10.1038/s41586-022-05136-8. （原始内容存档于2022-10-19） （英语）. 
  170. ^ Andreev, Plamen S.; Sansom, Ivan J.; Li, Qiang; Zhao, Wenjin; Wang, Jianhua; Wang, Chun-Chieh; Peng, Lijian; Jia, Liantao; Qiao, Tuo; Zhu, Min. The oldest gnathostome teeth. Nature. 2022-09, 609 (7929) [2022-10-21]. ISSN 1476-4687. doi:10.1038/s41586-022-05166-2. （原始内容存档于2022-10-21） （英语）. 
  171. ^ Andreev, Plamen S.; Sansom, Ivan J.; Li, Qiang; Zhao, Wenjin; Wang, Jianhua; Wang, Chun-Chieh; Peng, Lijian; Jia, Liantao; Qiao, Tuo; Zhu, Min. Spiny chondrichthyan from the lower Silurian of South China. Nature. 2022-09, 609 (7929) [2022-10-21]. ISSN 1476-4687. doi:10.1038/s41586-022-05233-8. （原始内容存档于2022-10-19） （英语）. 
  172. ^ 172.0 172.1 Cowen 2000
  173. ^ 173.0 173.1 173.2 Selden 2001, "Terrestrialization of Animals," pp. 71–74
  174. ^ 174.0 174.1 174.2 Garwood, Russell J.; Edgecombe, Gregory D. Early Terrestrial Animals, Evolution, and Uncertainty. Evolution: Education and Outreach. September 2011, 4 (3): 489–501. ISSN 1936-6434. doi:10.1007/s12052-011-0357-y  . 
  175. ^ Battistuzzi, Fabia U.; Feijao, Andreia; Hedges, S. Blair. A genomic timescale of prokaryote evolution: insights into the origin of methanogenesis, phototrophy, and the colonization of land. BMC Evolutionary Biology. 2004-11-09, 4: 44. ISSN 1471-2148. PMC 533871  . PMID 15535883. doi:10.1186/1471-2148-4-44. 
  176. ^ Weber, Büdel & Belnap 2016，第37–54页，第3章：Hugo Beraldi-Campesi与Gregory J. Retallack的“前寒武纪陆地生态系统”。doi:10.1007/978-3-319-30214-0_3：“......陆地生态系统确实存在，充满了生命，并且自太古宙就开始发挥作用。”
  177. ^ 177.0 177.1 177.2 177.3 177.4 177.5 177.6 Shear 2000, "The Early Development of Terrestrial Ecosystems," pp. 169–184
  178. ^ Smith, Deborah. Oldest evidence of life on land found in 3.48 billion-year-old Australian rocks (新闻稿). 澳大利亚悉尼: UNSW Media. 2017-05-10 [2020-07-14]. （原始内容存档于2020-07-10）. 
  179. ^ Djokic, Tara; Van Kranendonk, Martin J.; Campbell, Kathleen A.; et al. Earliest signs of life on land preserved in ca. 3.5 Ga hot spring deposits. 自然-通讯. 2017-05-09, 8: 15263. Bibcode:2017NatCo...815263D. ISSN 2041-1723. PMC 5436104  . PMID 28486437. doi:10.1038/ncomms15263. 
  180. ^ Homann, Martin; Sansjofre, Pierre; Van Zuilen, Mark; et al. Microbial life and biogeochemical cycling on land 3,220 million years ago (PDF). Nature Geoscience. 2018-09, 11 (9): 665–671 [2022-05-06]. Bibcode:2018NatGe..11..665H. ISSN 1752-0894. S2CID 134935568. doi:10.1038/s41561-018-0190-9. （原始内容 (PDF)存档于2021-05-09）. 
  181. ^ Zimmer, Carl. A Billion-Year-Old Fungus May Hold Clues to Life's Arrival on Land. Matter. New York Times (New York). 2019-05-22 [2019-05-23]. ISSN 0362-4331. （原始内容存档于2019-05-23）.  "A version of this article appears in print on May 28, 2019, Section D, Page 3 of the New York edition with the headline: Finding a Clue to Life's Arrival."
  182. ^ Loron, Corentin C.; François, Camille; Rainbird, Robert H.; et al. Early fungi from the Proterozoic era in Arctic Canada. Nature. 2019-06-13, 570 (7760): 232–235. Bibcode:2019Natur.570..232L. ISSN 0028-0836. PMID 31118507. S2CID 162180486. doi:10.1038/s41586-019-1217-0. 
  183. ^ Timmer, John. Billion-year-old fossils may be early fungus. Ars Technica. 2019-05-22 [2019-05-23]. （原始内容存档于2019-05-22）. 
  184. ^ 184.0 184.1 Venturi, Sebastiano. Evolutionary Significance of Iodine. Current Chemical Biology. 2011-09, 5 (3): 155–162. ISSN 2212-7968. doi:10.2174/187231311796765012. 
  185. ^ Crockford, Susan J. Evolutionary roots of iodine and thyroid hormones in cell-cell signaling. Integrative and Comparative Biology. 2009-08, 49 (2): 155–166. ISSN 1557-7023. PMID 21669854. doi:10.1093/icb/icp053  . 
  186. ^ Venturi, Sebastiano; Donati, Francesco M.; Venturi, Alessandro; et al. Environmental Iodine Deficiency: A Challenge to the Evolution of Terrestrial Life?. Thyroid. 2000-08, 10 (8): 727–729. ISSN 1050-7256. PMID 11014322. doi:10.1089/10507250050137851. 
  187. ^ Küpper, Frithjof C.; Carpenter, Lucy J.; McFiggans, Gordon B.; et al. Iodide accumulation provides kelp with an inorganic antioxidant impacting atmospheric chemistry. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008-05-13, 105 (19): 6954–6958. Bibcode:2008PNAS..105.6954K. ISSN 0027-8424. PMC 2383960  . PMID 18458346. doi:10.1073/pnas.0709959105  . 
  188. ^ Lidmar-Bergström, Karna; Bonow, Johan M.; Japsen, Peter. Stratigraphic Landscape Analysis and geomorphological paradigms: Scandinavia as an example of Phanerozoic uplift and subsidence. Global and Planetary Change. 2013-01, 100: 153–171. Bibcode:2013GPC...100..153L. ISSN 0921-8181. doi:10.1016/j.gloplacha.2012.10.015. 
  189. ^ Lidmar-Bergström, Karna. Denudation surfaces and tectonics in the southernmost part of the Baltic Shield. Precambrian Research. 1993-12, 64 (1–4): 337–345. Bibcode:1993PreR...64..337L. ISSN 0301-9268. doi:10.1016/0301-9268(93)90086-H. 
  190. ^ 190.0 190.1 Hawksworth, David L. Encyclopedia of Life Sciences. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons. 2002. ISBN 978-0-470-01617-6. doi:10.1038/npg.els.0000368. 
  191. ^ Retallack, Gregory J.; Feakes, Carolyn R. Trace Fossil Evidence for Late Ordovician Animals on Land. Science. 1987-01-02, 235 (4784): 61–63. Bibcode:1987Sci...235...61R. ISSN 0036-8075. PMID 17769314. S2CID 37351505. doi:10.1126/science.235.4784.61. 
  192. ^ 192.0 192.1 Kenrick, Paul; Crane, Peter R. The origin and early evolution of plants on land (PDF). Nature. 1997-09-04, 389 (6646): 33–39 [2015-02-10]. Bibcode:1997Natur.389...33K. ISSN 0028-0836. S2CID 3866183. doi:10.1038/37918. （原始内容 (PDF)存档于2016-03-03）. 
  193. ^ Scheckler 2001, "Afforestation—the First Forests," pp. 67–70
  194. ^ 该术语译自“Late Devonian wood crisis”，出于Tetrapoda: Acanthostega. Palaeos. [2015-02-10]. （原始内容存档于2021-08-15）. 
  195. ^ Taylor, Thomas N.; Osborn, Jeffrey M. The importance of fungi in shaping the paleoecosystem. Review of Palaeobotany and Palynology. 1996-02, 90 (3–4): 249–262. ISSN 0034-6667. doi:10.1016/0034-6667(95)00086-0. 
  196. ^ Wilson, Heather M.; Anderson, Lyall I. Morphology and taxonomy of Paleozoic millipedes (Diplopoda: Chilognatha: Archipolypoda) from Scotland. Journal of Paleontology. 2004-01, 78 (1): 169–184 [2022-05-06]. ISSN 0022-3360. doi:10.1666/0022-3360(2004)078<0169:MATOPM>2.0.CO;2. （原始内容存档于2020-05-30）. 
  197. ^ Selden, Paul; Read, Helen J. The Oldest Land Animals: Silurian Millipedes from Scotland (PDF). Bulletin of the British Myriapod and Isopod Group. 2008, 23: 36–37 [2015-07-21]. ISSN 0267-2154. （原始内容 (PDF)存档于2016-07-05）. 
  198. ^ Shear, William A.; Edgecombe, Gregory D. The geological record and phylogeny of the Myriapoda. Arthropod Structure & Development. 2010-03, 39 (2–3): 174–190. ISSN 1467-8039. PMID 19944188. doi:10.1016/j.asd.2009.11.002. 
  199. ^ MacNaughton, Robert B.; Cole, Jennifer M.; Dalrymple, Robert W.; et al. First steps on land: Arthropod trackways in Cambrian-Ordovician eolian sandstone, southeastern Ontario, Canada. Geology. 2002-05, 30 (5): 391–394. Bibcode:2002Geo....30..391M. ISSN 0091-7613. doi:10.1130/0091-7613(2002)030<0391:FSOLAT>2.0.CO;2. 
  200. ^ Vaccari, N. Emilio; Edgecombe, Gregory D.; Escudero, C. Cambrian origins and affinities of an enigmatic fossil group of arthropods. Nature. 2004-07-29, 430 (6999): 554–557. Bibcode:2004Natur.430..554V. ISSN 0028-0836. PMID 15282604. S2CID 4419235. doi:10.1038/nature02705. 
  201. ^ Buatois, Luis A.; Mangano, M. Gabriela; Genise, Jorge F.; et al. The Ichnologic Record of the Continental Invertebrate Invasion: Evolutionary Trends in Environmental Expansion, Ecospace Utilization, and Behavioral Complexity. PALAIOS. 1998-06, 13 (3): 217–240. Bibcode:1998Palai..13..217B. ISSN 0883-1351. JSTOR 3515447. doi:10.2307/3515447. 
  202. ^ Cowen 2000
  203. ^ 203.0 203.1 Grimaldi & Engel 2005
  204. ^ 204.0 204.1 204.2 Clack, Jennifer A. Getting a Leg Up on Land. Scientific American. Vol. 293 no. 6. December 2005: 100–107. Bibcode:2005SciAm.293f.100C. ISSN 0036-8733. PMID 16323697. doi:10.1038/scientificamerican1205-100. 
  205. ^ 205.0 205.1 Ahlberg, Per E.; Milner, Andrew R. The origin and early diversification of tetrapods. Nature. 1994-04-07, 368 (6471): 507–514. Bibcode:1994Natur.368..507A. ISSN 0028-0836. S2CID 4369342. doi:10.1038/368507a0. 
  206. ^ Gordon, Malcolm S.; Graham, Jeffrey B.; Wang, Tobias. Introduction to the Special Collection: Revisiting the Vertebrate Invasion of the Land. Physiological and Biochemical Zoology. 2004-09, 77 (5): 697–699. ISSN 1522-2152. S2CID 83750933. doi:10.1086/425182. 
  207. ^ Venturi and Bégin 2010, "Thyroid Hormone, Iodine and Human Brain Evolution," pp. 105–124 （页面存档备份，存于互联网档案馆）
  208. ^ Daeschler, Edward B.; Shubin, Neil H.; Jenkins, Farish A., Jr. A Devonian tetrapod-like fish and the evolution of the tetrapod body plan (PDF). Nature. 2006-04-06, 440 (7085): 757–763 [2020-07-26]. Bibcode:2006Natur.440..757D. ISSN 0028-0836. PMID 16598249. S2CID 4413217. doi:10.1038/nature04639  . （原始内容 (PDF)存档于2022-06-29）. 
  209. ^ deBraga, Michael; Rieppel, Olivier. Reptile phylogeny and the interrelationships of turtles. Zoological Journal of the Linnean Society. 1997-07, 120 (3): 281–354. ISSN 0024-4082. doi:10.1111/j.1096-3642.1997.tb01280.x  . 
  210. ^ 210.0 210.1 Benton, Michael J.; Donoghue, Philip C. J. Paleontological Evidence to Date the Tree of Life. Molecular Biology and Evolution. January 2007, 24 (1): 26–53. ISSN 0737-4038. PMID 17047029. doi:10.1093/molbev/msl150  . 
  211. ^ 211.0 211.1 Benton, Michael J. Phylogeny of the major tetrapod groups: Morphological data and divergence dates. Journal of Molecular Evolution. 1990-05, 30 (5): 409–424. Bibcode:1990JMolE..30..409B. ISSN 0022-2844. PMID 2111854. S2CID 35082873. doi:10.1007/BF02101113. 
  212. ^ Sidor, Christian A.; O'Keefe, F. Robin; Damiani, Ross; et al. Permian tetrapods from the Sahara show climate-controlled endemism in Pangaea. Nature. 2005-04-14, 434 (7035): 886–889. Bibcode:2005Natur.434..886S. ISSN 0028-0836. PMID 15829962. S2CID 4416647. doi:10.1038/nature03393. 
  213. ^ Smith, Roger; Botha, Jennifer. The recovery of terrestrial vertebrate diversity in the South African Karoo Basin after the end-Permian extinction. Comptes Rendus Palevol. 2005-09, 4 (6–7): 623–636. ISSN 1631-0683. doi:10.1016/j.crpv.2005.07.005. 
  214. ^ Benton 2005
  215. ^ Sahney, Sarda; Benton, Michael J. Recovery from the most profound mass extinction of all time. Proceedings of the Royal Society B. 2008-04-07, 275 (1636): 759–765. ISSN 0962-8452. PMC 2596898  . PMID 18198148. doi:10.1098/rspb.2007.1370. 
  216. ^ Gauthier et al. 1989，第345页
  217. ^ Benton, Michael J. Dinosaur Success in the Triassic: A Noncompetitive Ecological Model (PDF). The Quarterly Review of Biology. 1983-03, 58 (1): 29–55 [2008-09-08]. ISSN 0033-5770. JSTOR 2828101. S2CID 13846947. doi:10.1086/413056. （原始内容 (PDF)存档于2008-09-11）. 
  218. ^ 218.0 218.1 Padian 2004
  219. ^ Hou, Lian-hai; Zhou, Zhonghe; Martin, Larry D.; et al. A beaked bird from the Jurassic of China. Nature. 1995-10-19, 377 (6550): 616–618. Bibcode:1995Natur.377..616H. ISSN 0028-0836. S2CID 4357707. doi:10.1038/377616a0. 
  220. ^ Clarke, Julia A.; Zhou, Zhonghe; Zhang, Fucheng. Insight into the evolution of avian flight from a new clade of Early Cretaceous ornithurines from China and the morphology of Yixianornis grabaui. Journal of Anatomy. 2006-03, 208 (3): 287–308. ISSN 1469-7580. PMC 2100246  . PMID 16533313. doi:10.1111/j.1469-7580.2006.00534.x. 
  221. ^ Ruben, John A.; Jones, Terry D. Selective Factors Associated with the Origin of Fur and Feathers. Integrative and Comparative Biology. 2000-08, 40 (4): 585–596. ISSN 0003-1569. doi:10.1093/icb/40.4.585  . 
  222. ^ Zhe-Xi, Luo; Crompton, Alfred W.; Ai-Lin, Sun. A New Mammaliaform from the Early Jurassic and Evolution of Mammalian Characteristics. Science. 2001-05-25, 292 (5521): 1535–1540. Bibcode:2001Sci...292.1535L. ISSN 0036-8075. PMID 11375489. S2CID 8738213. doi:10.1126/science.1058476. 
  223. ^ Cifelli, Richard L. Early mammalian radiations. Journal of Paleontology. 2001-11, 75 (6): 1214–1226 [2015-02-16]. ISSN 0022-3360. doi:10.1666/0022-3360(2001)075<1214:EMR>2.0.CO;2. （原始内容存档于2020-05-30）. 
  224. ^ Flynn, John J.; Parrish, J. Michael; Rakotosamimanana, Berthe; et al. A Middle Jurassic mammal from Madagascar. Nature. 1999-09-02, 401 (6748): 57–60. Bibcode:1999Natur.401...57F. ISSN 0028-0836. S2CID 40903258. doi:10.1038/43420. 
  225. ^ MacLeod, Norman; Rawson, Peter F.; Forey, Peter L.; et al. The Cretaceous–Tertiary biotic transition. Journal of the Geological Society. 1997-04, 154 (2): 265–292 [2015-02-16]. Bibcode:1997JGSoc.154..265M. ISSN 0016-7649. S2CID 129654916. doi:10.1144/gsjgs.154.2.0265. （原始内容存档于2020-05-30）. 
  226. ^ Alroy, John. The Fossil Record of North American Mammals: Evidence for a Paleocene Evolutionary Radiation. Systematic Biology. 1999-03, 48 (1): 107–118. ISSN 1063-5157. PMID 12078635. doi:10.1080/106351599260472  . 
  227. ^ Archibald, J. David; Deutschman, Douglas H. Quantitative Analysis of the Timing of the Origin and Diversification of Extant Placental Orders (PDF). Journal of Mammalian Evolution. 2001-06, 8 (2): 107–124 [2015-02-16]. ISSN 1064-7554. S2CID 15581162. doi:10.1023/A:1011317930838. （原始内容存档 (PDF)于2009-07-09）. 
  228. ^ Simmons, Nancy B.; Seymour, Kevin L.; Habersetzer, Jörg; et al. Primitive Early Eocene bat from Wyoming and the evolution of flight and echolocation. Nature. 2008-02-14, 451 (7180): 818–821. Bibcode:2008Natur.451..818S. ISSN 0028-0836. PMID 18270539. S2CID 4356708. doi:10.1038/nature06549. hdl:2027.42/62816  . 
  229. ^ Thewissen, Madar & Hussain 1996
  230. ^ 230.0 230.1 230.2 230.3 Crane, Friis and Pedersen 2000, "The Origin and Early Diversification of Angiosperms," pp. 233–250
  231. ^ 231.0 231.1 231.2 231.3 Crepet, William L. Progress in understanding angiosperm history, success, and relationships: Darwin's abominably 'perplexing phenomenon'. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000-11-21, 97 (24): 12939–12941. Bibcode:2000PNAS...9712939C. ISSN 0027-8424. PMC 34068  . PMID 11087846. doi:10.1073/pnas.97.24.12939  . 
  232. ^ evolution: plant timeline. Encyclopædia Britannica Online. Encyclopædia Britannica, Inc. 1996 [2020-10-23]. ISBN 9780691185507. OCLC 42796406. （原始内容存档于2015-03-27）. 
  233. ^ 233.0 233.1 Wilson, Edward O.; Hölldobler, Bert. Eusociality: Origin and consequences. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005-09-20, 102 (38): 13367–13371. Bibcode:2005PNAS..10213367W. ISSN 0027-8424. PMC 1224642  . PMID 16157878. doi:10.1073/pnas.0505858102  . 
  234. ^ Hughes, William O. H.; Oldroyd, Benjamin P.; Beekman, Madeleine; Ratnieks, Francis L. W. Ancestral Monogamy Shows Kin Selection Is Key to the Evolution of Eusociality. Science. 2008-05-30, 320 (5880): 1213–1216. Bibcode:2008Sci...320.1213H. ISSN 0036-8075. PMID 18511689. S2CID 20388889. doi:10.1126/science.1156108. 
  235. ^ Lovegrove, Barry G. The evolution of eusociality in molerats (Bathyergidae): a question of risks, numbers, and costs. Behavioral Ecology and Sociobiology. 1991-01, 28 (1): 37–45. ISSN 0340-5443. S2CID 36466393. doi:10.1007/BF00172137. 
  236. ^ Labandeira & Eble 1999
  237. ^ Montgomery, Stephen. Darwin & The Descent of Man. Charles Darwin & Evolution. Cambridge: Christ's College. 2009 [2020-11-19]. 原始内容存档于2019-06-20. 
  238. ^ Brunet, Michel; Guy, Franck; Pilbeam, David; et al. A new hominid from the Upper Miocene of Chad, Central Africa. Nature. 2002-07-11, 418 (6894): 145–151. Bibcode:2002Natur.418..145B. ISSN 0028-0836. PMID 12110880. S2CID 1316969. doi:10.1038/nature00879. 
  239. ^ de Heinzelin, Jean; Clark, J. Desmond; White, Tim; et al. Environment and Behavior of 2.5-Million-Year-Old Bouri Hominids. Science. 1999-04-23, 284 (5414): 625–629. Bibcode:1999Sci...284..625D. ISSN 0036-8075. PMID 10213682. doi:10.1126/science.284.5414.625. 
  240. ^ De Miguel, Carmen; Henneberg, Maciej. Variation in hominid brain size: How much is due to method?. HOMO. 2001, 52 (1): 3–58. ISSN 0018-442X. PMID 11515396. doi:10.1078/0018-442X-00019. 
  241. ^ Leakey 1994
  242. ^ Mellars, Paul. Why did modern human populations disperse from Africa ca. 60,000 years ago? A new model. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006-06-20, 103 (25): 9381–9386. Bibcode:2006PNAS..103.9381M. ISSN 0027-8424. PMC 1480416  . PMID 16772383. doi:10.1073/pnas.0510792103  . 
  243. ^ Benton 2005a，Chapter 6: "Tetrapods of the Triassic"
  244. ^ 244.0 244.1 MacLeod, Norman. Extinction!. FirstScience.com. 1999 [2020-12-25]. （原始内容存档于2000-08-19）. 
  245. ^ Martin, Ronald E. Cyclic and secular variation in microfossil biomineralization: clues to the biogeochemical evolution of Phanerozoic oceans. Global and Planetary Change. 1995-06, 11 (1–2): 1–23. Bibcode:1995GPC....11....1M. ISSN 0921-8181. doi:10.1016/0921-8181(94)00011-2. 
  246. ^ Martin, Ronald E. Secular Increase in Nutrient Levels through the Phanerozoic: Implications for Productivity, Biomass, and Diversity of the Marine Biosphere. PALAIOS. 1996-06, 11 (3): 209–219. Bibcode:1996Palai..11..209M. ISSN 0883-1351. JSTOR 3515230. doi:10.2307/3515230. 
  247. ^ 247.0 247.1 Rohde, Robert A.; Muller, Richard A. Cycles in fossil diversity (PDF). Nature. 2005-03-10, 434 (7030): 208–210 [2008-09-22]. Bibcode:2005Natur.434..208R. ISSN 0028-0836. PMID 15758998. S2CID 32520208. doi:10.1038/nature03339. （原始内容 (PDF)存档于2008-10-03）. 

参考资料

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外部链接

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