生态系统多样性（英语：Ecosystem diversity），可指一个地区的生态系统层次上的多样性，或一个生物圈中的各种生态系统。此词语和生物多样性不同，生物多样性是指是生物或物种变化的程度，不一定是指生态系统。
以下是一些具有多样性的生态系统：
