沈肩元(?年—1638年),號玉虹,南直隸蘇州府長洲縣人。明末政治人物。
天啓七年(1627年)丁卯科應天府鄉試第一百四十名舉人,崇禎七年(1634年)甲戌科三甲一百二十名進士,禮部觀政,八年授江西浮梁縣知縣,十年養病,次年卒[1]。
曾祖沈相,祖沈瑜,父沈邦濟。