線粒體基質蛋白質

線粒體基質蛋白質（英語：mitochondrial matrix protein）是對存在於線粒體基質中的蛋白質的統稱。線粒體基質中蛋白質濃度較高，但其中只有極少數是由線粒體基因組內的基因編碼的，絕大多數是由核基因編碼，經轉錄並由細胞質基質中的游離核糖體翻譯產生的。這些蛋白質包括DNA聚合酶、RNA聚合酶、檸檬酸合成酶、乙醇脫氫酶（酵母菌）、鳥氨酸氨基轉移酶（哺乳動物）以及三羧酸循環酶系中的酶類等。在細胞質基質中合成的線粒體基質蛋白的轉運過程較為複雜，它們需要在轉運肽及多種分子伴侶的輔助下經主動運輸才能進入線粒體基質。線粒體基質蛋白不一定只在線粒體基質中表達，它們也可以在線粒體外表達。有猜測認為，這些存在於線粒體外的線粒體基質蛋白質是從線粒體中轉運出去的，而此現象可能與線粒體起源於被真核細胞胞吞的原核細胞有關。

有研究指出，在肝臟受損後再生的初期一些線粒體基質蛋白會被釋放到細胞質基質中，這一現象說明線粒體基質蛋白的釋放可能與組織再生有一定的聯繫。