裴行本（?—?），唐朝大臣。出自河東裴氏南來吳裴。祖父裴獻，隋朝扶州刺史，臨汾郡公、父親裴義山。
691年九月廿六，時任冬官侍郎（工部侍郎）的裴行本被任命為同鳳閣鸞臺平章事。692年，他和宰相狄仁傑、任知古、司禮卿崔宣禮、前文昌左丞盧獻、御史中丞魏元忠、潞州刺史李嗣真被武則天手下酷吏來俊臣彈劾謀反。由於狄仁傑將一份表章藏在衣物中讓家人帶回，得以向武則天澄清眾人並未謀反，眾人免於一死，但仍被流放。一月初四，流放裴行本、李嗣真於嶺南。來俊臣說裴行本罪惡尤重，應當處死；秋官郎中徐有功反駁，以為「明主有使使臣下再生之恩，來俊臣不能順勢促成，有損君王的恩信。」
