亲缘系数
亲缘系数(英语:coefficient of relationship)是两个个体之间血缘关系(或生物学关系)程度的度量,由休厄尔·赖特于1922年定义,源自他在1921年对近交系数的定义。该衡量方法常用于遗传学和系谱学。近交系数用于单个个体,通常为父本与母本之间的亲缘系数的二分之一。
一般来说,近交程度越高,亲本之间的关系系数越接近1,以百分比表示[a],对于遗传关系很远的共同祖先的个体,其数值接近0。
亲缘系数
两个个体B和C之间的亲缘系数(r)可通过对它们与共同祖先相连的每条路径的系数进行求和获得。每条这样的线都经由一个共同的祖先将两个人连接起来,通过非共同祖先个体的次数不多于一次。相差n代的祖先A和后代O之间的路径系数如下:
其中fA和fO分别是A和O的近交系数。
亲缘系数rBC可通过对所有路径系数求和获得:
假设谱系可以追溯到一个足够遥远的完全随机繁殖的种群(对于求和计算中的所有A,fA = 0),则r的定义可以简化为
其中p枚举连接经由一个共同祖先连接B和C的所有路径(即所有路径于共同祖先终止,不再经共同祖先向上追索到共同祖先的祖先),L(p)是路径p的长度。
举一个虚构的例子:假设两人在n = 5代前有32个共同祖先,但在4代以内无任何共同祖先,则他们的亲缘系数为
- ,当n = 5时为 ,约等于0.0313或3%。
相同条件下,可追索到十代前1024位祖先的两人的亲缘系数为r = 2-10 = 0.1%。如果双方个体的族谱在5代内已知,则r的值可以达到百分之几的准确度,如果已知至少10代,则精度为百分之零点几。20代前的共同祖先(人类谱系中大约对应500年的时间尺度)对r的贡献低于百万分之一。
人类关系
亲缘系数有时用于在人类家谱中量化表示亲属关系的程度。
在人类关系中,亲缘系数的值通常是根据相对较少代数的完整族谱来计算得出的,可能是三到四代。如上所述,这样计算的亲缘系数的值因而是一个下限,实际值有可能高出多达几个百分点。如果两人的完整家谱的已知深度为七代,则误差在1%以内。[c]
参见
注释
参考文献
参考书目
- Wright, Sewall. Systems of Mating (PDF). Genetics. 1921, 6 (2): 111–178 [2022-06-14]. PMC 1200510 . doi:10.1093/genetics/6.2.111. (原始内容存档 (PDF)于2015-09-24). five papers:
- I) The biometric relations between offspring and parent
- II) The effects of inbreeding on the genetic composition of a population
- III) Assortative mating based on somatic resemblance
- IV) The effects of selection
- V) General considerations
- Wright, Sewall. Coefficients of inbreeding and relationship. American Naturalist. 1922, 56 (645): 330–338 [2022-06-14]. S2CID 83865141. doi:10.1086/279872. (原始内容存档于2022-06-16).
- Malécot, G. (1948) Les mathématiques de l’hérédité, Masson et Cie, Paris.
- Lange, K. (1997) Mathematical and statistical methods for genetic analysis, Springer-Verlag, New-York.
- Oliehoek, Pieter; Jack J. Windig; Johan A. M. van Arendonk; Piter Bijma. Estimating Relatedness Between Individuals in General Populations With a Focus on Their Use in Conservation Programs. Genetics. May 2006, 173 (1): 483–496. PMC 1461426 . PMID 16510792. doi:10.1534/genetics.105.049940.