大脑模拟
大脑模拟是指对完整或部分的大脑进行功能性的电脑建模。若要对大脑(或大脑子系统)建模,就要同时对神经元的电学性质和体化学性质(如细胞外血清素梯度)进行建模以及目标生物的神经连接组模型。神经连接组极其复杂,详细连接方式尚不明了;因此目前正透过蓝脑计划等专案在小型哺乳动物中进行实验模拟。
世界各地的各种模拟已全部或部分以开源形式发布,如C. elegans[1]和蓝脑计划展示。
蓝脑计划想要对哺乳动物皮层柱建立下至分子等级的电脑模拟。[2]根据一项估计,使用蓝脑计划的方法对人类连接组进行全面重建将需要zettabyte的资料储存量。在2013年,人脑计划建立了脑模拟平台(Brain Simulation Platform,BSP),这是可透过互联网存取,为了模拟大脑模型而设计的协作平台,。人脑计划运用了蓝脑计划所使用的技术,并在此基础上改进。[3]
秀丽隐杆线虫(蛔虫)
秀丽隐杆线虫(蛔虫)的触觉敏感性的神经回路连通图在1985 年[5]绘制完成,并在 1993 年进行了部分模拟。[6]自 2004 年以来已有许多完整的神经及肌肉系统的软件模拟开发完成,包括蠕虫的物理环境模拟,其中有一些模型可供下载。[7] [8]然而,对于在这种相对简单的生物体中,神经元及其连接是如何产生令人惊讶的一系列复杂行为,这方面的理解仍付之阙如。[9] [10]整体大脑功能有着过度的复杂性,与所绘相邻神经元之间相互作用的简单性呈鲜明对比,这种反差就是涌现属性的一个例子,[11]涌现在人工神经网络中有平行的特性,与它们往往很复杂的抽象输出相比,人工神经网络的神经元则极其简单。
果蝇神经系统
老鼠大脑成像和类比
亨利·马克拉姆在1995年至2005年间绘制了老鼠大脑中的神经元类型及其连结图。[来源请求]
2006年12月,[13]蓝脑计划完成了对老鼠新皮层柱的模拟。新皮层柱被认为是新皮层最小的功能单元。新皮层是大脑的一部分,被认为是负责如意识思维等高阶功能,老鼠大脑中含有10000个神经元(和10 8个突触)。2007年11月,[14]该计划报告结束了第一阶段,并提供了一个依照数据处理的流程,用于建立、验证和研究新皮层柱。
2007年,内华达大学的研究团队在IBM的超级电脑蓝色基因上执行了“与半颗老鼠大脑一样大、一样复杂的 ”人工神经网络[15]。每模拟一秒钟的时间需花费十秒钟的计算时间。研究人员声称观察到了“与生物学一致的”神经冲动在虚拟大脑皮层流过。然而,该模拟缺乏了在真实老鼠大脑中看到的结构,而且他们还打算改进神经元和突触模型的准确性。[16]
蓝脑和老鼠
蓝脑计划是IBM和瑞士洛桑联邦理工学院于2005年5月发起的一项计划。计划之目的在于,在分子等级之上建立对哺乳动物皮层柱的电脑模拟[2]。该项计划使用了基于IBM蓝色基因所设计的超级电脑,根据神经元的突触连接性和离子渗透性来模拟神经元的电性行为。该计划试图最终了解人类认知,以及由神经功能失调所引起的各种精神疾病(例如自闭症),并了解药物是如何影响网络行为。
超级电脑“京”和人脑
2013年底,日本和德国的研究人员使用当时排名第四的超级电脑“京”和脉冲神经网络模拟平台“NEST”来模拟1%的人脑。该模拟建立了一个由17.3亿个神经细胞组成的网络模型,神经细胞以10.4兆个突触连接。为了实现这一壮举,该程序使用了京的82944个处理器,过程花了40分钟,完成了真实生物神经网络活动1秒钟的模拟[17][18] 。
人脑计划
人脑计划(HBP)是由欧盟资助的研究计划,从2013年开始,为期10年,在欧洲雇用了约500名科学家,包含6个平台:
大脑模拟平台(Brain Simulation Platform,BSP)是可存取互联网的平台,它可以进行那些不易在实验室实行的调查。目前正在将蓝脑技术应用于其他脑区,如小脑、海马回和基底核。[19]
开源大脑模拟
大脑模型已经作为开源软件发布,可在GitHub等网站上获得。其中包括秀丽隐杆线虫[20]、果蝇[21],以及世界上最大的功能性大脑模型[22]——在NENGO软件架构基础上开发的人脑模型“Elysia”[23]和“Spaun”[24]。
蓝脑计划的展示网页说明了蓝脑计划的模型和资料是如何转换为NeuroML和PyNN(Python的神经网络模型)。[25]
参考文献
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