小卡哈尔体RNA

小卡哈尔体RNA(Small Cajal body-specific RNA,简称scaRNA)是动物细胞核卡哈尔体中的一类H/ACA匣(H/ACA box)snoRNA[1],卡哈尔体为细胞组装核小核糖核蛋白(snRNP)的位置。ScaRNA可在卡哈尔体中参与U1剪接体RNA英语U1 spliceosomal RNAU2剪接体RNA英语U2 spliceosomal RNAU4剪接体RNA英语U4 spliceosomal RNAU5剪接体RNA英语U5 spliceosomal RNAU12次要剪接体RNA英语U12 minor spliceosomal RNA等剪接体RNA的甲基化2'-O-甲基化)与假尿苷化修饰,另外果蝇的scaRNA还参与28S rRNA的修饰[2]。最早被发现的小卡哈尔体为U85 RNA,于2011年在人类细胞中发现[3]

小卡哈尔体RNA
小卡哈尔体RNA1的次级结构
识别符
代号 SCARNA1
Rfam RF00553
其他数据
RNA类型 snoRNA、scaRNA
动物

多数snoRNA与scaRNA均位于内含子中,随其他基因一起转录,但有少数scaRNA为RNA聚合酶II独立转录[4],此类scaRNA中有数个还可被DGCR8Drosha切割成更小的RNA碎片,这些碎片于核仁中可与其他蛋白组成RNP,可影响snoRNA对rRNA的修饰[5]

参考文献