真核起始因子4A(英语:eukaryotic translation Initiation Factor 4A,简称为eIF4A)是一种ATP依赖性RNA结合蛋白,一种RNA依赖性ATP酶,和一种RNA解旋酶,它在真核翻译起始进程中发挥重要作用。它被认为可以解开mRNA5'端非翻译区的二级和三级结构,以使核糖体的附着更容易,同时允许核糖体进行起始密码子扫描。[1]

真核起始因子4A-1
识别
符号 eIF4A-1
Entrez 1973
OMIM 602641
RefSeq NP_001407
UniProt P60842
其他资料
EC编号 3.6.1.-
基因座 17 [1]
真核起始因子4A-2
识别
符号 eIF4A-2
Entrez 1974
OMIM 601102
RefSeq NP_001958
UniProt Q14240
其他资料
EC编号 3.6.1.-
基因座 3 [2]
真核起始因子4A-3
人类eIF4A-3的晶体结构
识别
符号 eIF4A-3
Entrez 9775
OMIM 608546
PDB 2hxy
RefSeq NP_055555
UniProt P38919
其他资料
EC编号 3.6.1.-
基因座 17 [3]

eIF4A在人体中有三个亚型:eIF4A-1、eIF4A-2和eIF4A-3。

结构

eIF4A是DEAD盒RNA解旋酶超家族成员,其氨基酸序列中具有8个保守区,保守区内含有一致的特殊序列。已知的解旋酶结构具有两个结构域:RNA结合结构域和ATP酶结构域;保守区,包括ATP结合位点,线性排列在两个结构域之间的裂缝中。酵母的eIF4A(缺少RNA结合结构域)的N端ATP酶结构域包含一个七个β链组成的扭曲的β折叠片,其两侧分别有4个和5个α螺旋[2] 而最近对人类eIF4A的结构研究发现,eIF4A的两个结构域都为α/β型折叠,且在结合RNA前后发生了构象变化。[3]

功能

eIF4A的解旋功能可能是因为ATP结合和水解引起蛋白质结构变化和RNA亲合性的变化。虽然如此,单独存在的eIF4A只是一种低效的解旋酶,因为它从单链RNA上脱离的速率远大于水解ATP的速率。而eIF4A的解旋酶活性可被eIF4BeIF4HeIF4F增强。现在还不清楚这些因子是否或如何通过与eIF4A的相互作用改变了酶的动力学参数,例如通过增强它与RNA的亲合性从而带来活性的提高。

在真核生物中,eIF4A可以以自由形式存在或者作为eIF4F的一部分。在哺乳动物中eIF4A是结合eIF4G的两个位点上,在酵母中结合在eIF4G的一个单独位点上。[4] 它同样可结合翻译调控因子p97PABP作用蛋白(PABP-interacting protein,PAIP)。

参考文献

  1. ^ (英文)Hernández G, Vazquez-Pianzola P. Functional diversity of the eukaryotic translation initiation factors belonging to eIF4 families. Mech Dev. 2005, 122: 865–76. PMID 15922571. 
  2. ^ (英文)Benz J, Trachsel H, Baumann U. Crystal structure of the ATPase domain of translation initiation factor 4A from Saccharomyces cerevisiae--the prototype of the DEAD box protein family. Structure. 1999, 15: 671–9. PMID 10404596. 
  3. ^ (英文)Andersen CB, Ballut L, Johansen JS, Chamieh H, Nielsen KH, Oliveira CL, Pedersen JS, Séraphin B, Le Hir H, Andersen GR. Structure of the exon junction core complex with a trapped DEAD-box ATPase bound to RNA. Science. 2006, 313: 1968–72. PMID 16931718. 
  4. ^ (英文)Imataka H, Sonenberg N. Human eukaryotic translation initiation factor 4G (eIF4G) possesses two separate and independent binding sites for eIF4A. Mol Cell Biol. 1997, 17: 6940–7. PMID 9372926. 

参见