eIF4A
真核起始因子4A（英语：eukaryotic translation Initiation Factor 4A，简称为eIF4A）是一种ATP依赖性RNA结合蛋白，一种RNA依赖性ATP酶，和一种RNA解旋酶，它在真核翻译起始进程中发挥重要作用。它被认为可以解开mRNA的5'端非翻译区的二级和三级结构，以使核糖体的附着更容易，同时允许核糖体进行起始密码子扫描。[1]
| 真核起始因子4A-1 | |
|---|---|
| 识别 | |
| 符号 | eIF4A-1 |
| Entrez | 1973 |
| OMIM | 602641 |
| RefSeq | NP_001407 |
| UniProt | P60842 |
| 其他资料 | |
| EC编号 | 3.6.1.- |
| 基因座 | 17 [1] |
| 真核起始因子4A-2 | |
|---|---|
| 识别 | |
| 符号 | eIF4A-2 |
| Entrez | 1974 |
| OMIM | 601102 |
| RefSeq | NP_001958 |
| UniProt | Q14240 |
| 其他资料 | |
| EC编号 | 3.6.1.- |
| 基因座 | 3 [2] |
| 真核起始因子4A-3 | |
|---|---|
| |
| 人类eIF4A-3的晶体结构 | |
| 识别 | |
| 符号 | eIF4A-3 |
| Entrez | 9775 |
| OMIM | 608546 |
| PDB | 2hxy |
| RefSeq | NP_055555 |
| UniProt | P38919 |
| 其他资料 | |
| EC编号 | 3.6.1.- |
| 基因座 | 17 [3] |
eIF4A在人体中有三个亚型：eIF4A-1、eIF4A-2和eIF4A-3。
结构
eIF4A是DEAD盒RNA解旋酶超家族成员，其氨基酸序列中具有8个保守区，保守区内含有一致的特殊序列。已知的解旋酶结构具有两个结构域：RNA结合结构域和ATP酶结构域；保守区，包括ATP结合位点，线性排列在两个结构域之间的裂缝中。酵母的eIF4A（缺少RNA结合结构域）的N端ATP酶结构域包含一个七个β链组成的扭曲的β折叠片，其两侧分别有4个和5个α螺旋。[2] 而最近对人类eIF4A的结构研究发现，eIF4A的两个结构域都为α/β型折叠，且在结合RNA前后发生了构象变化。[3]
功能
eIF4A的解旋功能可能是因为ATP结合和水解引起蛋白质结构变化和RNA亲合性的变化。虽然如此，单独存在的eIF4A只是一种低效的解旋酶，因为它从单链RNA上脱离的速率远大于水解ATP的速率。而eIF4A的解旋酶活性可被eIF4B，eIF4H和eIF4F增强。现在还不清楚这些因子是否或如何通过与eIF4A的相互作用改变了酶的动力学参数，例如通过增强它与RNA的亲合性从而带来活性的提高。
在真核生物中，eIF4A可以以自由形式存在或者作为eIF4F的一部分。在哺乳动物中eIF4A是结合eIF4G的两个位点上，在酵母中结合在eIF4G的一个单独位点上。[4] 它同样可结合翻译调控因子p97和PABP作用蛋白（PABP-interacting protein，PAIP）。
参考文献
- ^ （英文）Hernández G, Vazquez-Pianzola P. Functional diversity of the eukaryotic translation initiation factors belonging to eIF4 families. Mech Dev. 2005, 122: 865–76. PMID 15922571.
- ^ （英文）Benz J, Trachsel H, Baumann U. Crystal structure of the ATPase domain of translation initiation factor 4A from Saccharomyces cerevisiae--the prototype of the DEAD box protein family. Structure. 1999, 15: 671–9. PMID 10404596.
- ^ （英文）Andersen CB, Ballut L, Johansen JS, Chamieh H, Nielsen KH, Oliveira CL, Pedersen JS, Séraphin B, Le Hir H, Andersen GR. Structure of the exon junction core complex with a trapped DEAD-box ATPase bound to RNA. Science. 2006, 313: 1968–72. PMID 16931718.
- ^ （英文）Imataka H, Sonenberg N. Human eukaryotic translation initiation factor 4G (eIF4G) possesses two separate and independent binding sites for eIF4A. Mol Cell Biol. 1997, 17: 6940–7. PMID 9372926.