真核起始因子4A(英語:eukaryotic translation Initiation Factor 4A,簡稱為eIF4A)是一種ATP依賴性RNA結合蛋白,一種RNA依賴性ATP酶,和一種RNA解旋酶,它在真核翻譯起始進程中發揮重要作用。它被認為可以解開mRNA5'端非翻譯區的二級和三級結構,以使核糖體的附着更容易,同時允許核糖體進行起始密碼子掃描。[1]

真核起始因子4A-1
識別
符號 eIF4A-1
Entrez 1973
OMIM 602641
RefSeq NP_001407
UniProt P60842
其他資料
EC編號 3.6.1.-
基因座 17 [1]
真核起始因子4A-2
識別
符號 eIF4A-2
Entrez 1974
OMIM 601102
RefSeq NP_001958
UniProt Q14240
其他資料
EC編號 3.6.1.-
基因座 3 [2]
真核起始因子4A-3
人類eIF4A-3的晶體結構
識別
符號 eIF4A-3
Entrez 9775
OMIM 608546
PDB 2hxy
RefSeq NP_055555
UniProt P38919
其他資料
EC編號 3.6.1.-
基因座 17 [3]

eIF4A在人體中有三個亞型:eIF4A-1、eIF4A-2和eIF4A-3。

結構

eIF4A是DEAD盒RNA解旋酶超家族成員,其氨基酸序列中具有8個保守區,保守區內含有一致的特殊序列。已知的解旋酶結構具有兩個結構域:RNA結合結構域和ATP酶結構域;保守區,包括ATP結合位點,線性排列在兩個結構域之間的裂縫中。酵母的eIF4A(缺少RNA結合結構域)的N端ATP酶結構域包含一個七個β鏈組成的扭曲的β摺疊片,其兩側分別有4個和5個α螺旋[2] 而最近對人類eIF4A的結構研究發現,eIF4A的兩個結構域都為α/β型摺疊,且在結合RNA前後發生了構象變化。[3]

功能

eIF4A的解旋功能可能是因為ATP結合和水解引起蛋白質結構變化和RNA親合性的變化。雖然如此,單獨存在的eIF4A只是一種低效的解旋酶,因為它從單鏈RNA上脫離的速率遠大於水解ATP的速率。而eIF4A的解旋酶活性可被eIF4BeIF4HeIF4F增強。現在還不清楚這些因子是否或如何通過與eIF4A的相互作用改變了酶的動力學參數,例如通過增強它與RNA的親合性從而帶來活性的提高。

在真核生物中,eIF4A可以以自由形式存在或者作為eIF4F的一部分。在哺乳動物中eIF4A是結合eIF4G的兩個位點上,在酵母中結合在eIF4G的一個單獨位點上。[4] 它同樣可結合翻譯調控因子p97PABP作用蛋白(PABP-interacting protein,PAIP)。

參考文獻

  1. ^ (英文)Hernández G, Vazquez-Pianzola P. Functional diversity of the eukaryotic translation initiation factors belonging to eIF4 families. Mech Dev. 2005, 122: 865–76. PMID 15922571. 
  2. ^ (英文)Benz J, Trachsel H, Baumann U. Crystal structure of the ATPase domain of translation initiation factor 4A from Saccharomyces cerevisiae--the prototype of the DEAD box protein family. Structure. 1999, 15: 671–9. PMID 10404596. 
  3. ^ (英文)Andersen CB, Ballut L, Johansen JS, Chamieh H, Nielsen KH, Oliveira CL, Pedersen JS, Séraphin B, Le Hir H, Andersen GR. Structure of the exon junction core complex with a trapped DEAD-box ATPase bound to RNA. Science. 2006, 313: 1968–72. PMID 16931718. 
  4. ^ (英文)Imataka H, Sonenberg N. Human eukaryotic translation initiation factor 4G (eIF4G) possesses two separate and independent binding sites for eIF4A. Mol Cell Biol. 1997, 17: 6940–7. PMID 9372926. 

參見