eIF4A
真核起始因子4A（英語：eukaryotic translation Initiation Factor 4A，簡稱為eIF4A）是一種ATP依賴性RNA結合蛋白，一種RNA依賴性ATP酶，和一種RNA解旋酶，它在真核翻譯起始進程中發揮重要作用。它被認為可以解開mRNA的5'端非翻譯區的二級和三級結構，以使核糖體的附著更容易，同時允許核糖體進行起始密碼子掃描。[1]
| 真核起始因子4A-1 | |
|---|---|
| 識別 | |
| 符號 | eIF4A-1 |
| Entrez | 1973 |
| OMIM | 602641 |
| RefSeq | NP_001407 |
| UniProt | P60842 |
| 其他資料 | |
| EC編號 | 3.6.1.- |
| 基因座 | 17 [1] |
| 真核起始因子4A-2 | |
|---|---|
| 識別 | |
| 符號 | eIF4A-2 |
| Entrez | 1974 |
| OMIM | 601102 |
| RefSeq | NP_001958 |
| UniProt | Q14240 |
| 其他資料 | |
| EC編號 | 3.6.1.- |
| 基因座 | 3 [2] |
| 真核起始因子4A-3 | |
|---|---|
| |
| 人類eIF4A-3的晶體結構 | |
| 識別 | |
| 符號 | eIF4A-3 |
| Entrez | 9775 |
| OMIM | 608546 |
| PDB | 2hxy |
| RefSeq | NP_055555 |
| UniProt | P38919 |
| 其他資料 | |
| EC編號 | 3.6.1.- |
| 基因座 | 17 [3] |
eIF4A在人體中有三個亞型：eIF4A-1、eIF4A-2和eIF4A-3。
結構
eIF4A是DEAD盒RNA解旋酶超家族成員，其胺基酸序列中具有8個保守區，保守區內含有一致的特殊序列。已知的解旋酶結構具有兩個結構域：RNA結合結構域和ATP酶結構域；保守區，包括ATP結合位點，線性排列在兩個結構域之間的裂縫中。酵母的eIF4A（缺少RNA結合結構域）的N端ATP酶結構域包含一個七個β鏈組成的扭曲的β摺疊片，其兩側分別有4個和5個α螺旋。[2] 而最近對人類eIF4A的結構研究發現，eIF4A的兩個結構域都為α/β型摺疊，且在結合RNA前後發生了構象變化。[3]
功能
eIF4A的解旋功能可能是因為ATP結合和水解引起蛋白質結構變化和RNA親合性的變化。雖然如此，單獨存在的eIF4A只是一種低效的解旋酶，因為它從單鏈RNA上脫離的速率遠大於水解ATP的速率。而eIF4A的解旋酶活性可被eIF4B，eIF4H和eIF4F增強。現在還不清楚這些因子是否或如何通過與eIF4A的相互作用改變了酶的動力學參數，例如通過增強它與RNA的親合性從而帶來活性的提高。
在真核生物中，eIF4A可以以自由形式存在或者作為eIF4F的一部分。在哺乳動物中eIF4A是結合eIF4G的兩個位點上，在酵母中結合在eIF4G的一個單獨位點上。[4] 它同樣可結合翻譯調控因子p97和PABP作用蛋白（PABP-interacting protein，PAIP）。
參考文獻
- ^ （英文）Hernández G, Vazquez-Pianzola P. Functional diversity of the eukaryotic translation initiation factors belonging to eIF4 families. Mech Dev. 2005, 122: 865–76. PMID 15922571.
- ^ （英文）Benz J, Trachsel H, Baumann U. Crystal structure of the ATPase domain of translation initiation factor 4A from Saccharomyces cerevisiae--the prototype of the DEAD box protein family. Structure. 1999, 15: 671–9. PMID 10404596.
- ^ （英文）Andersen CB, Ballut L, Johansen JS, Chamieh H, Nielsen KH, Oliveira CL, Pedersen JS, Séraphin B, Le Hir H, Andersen GR. Structure of the exon junction core complex with a trapped DEAD-box ATPase bound to RNA. Science. 2006, 313: 1968–72. PMID 16931718.
- ^ （英文）Imataka H, Sonenberg N. Human eukaryotic translation initiation factor 4G (eIF4G) possesses two separate and independent binding sites for eIF4A. Mol Cell Biol. 1997, 17: 6940–7. PMID 9372926.